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szylnl

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】调取基因 已有6人参与

我现在纯化了一个酵母的蛋白,经过LC-MS-MS分析得知了这个蛋白的很多的氨基酸片段序列,怎么才能得这个蛋白质的基因啊?有文献说构建cDNA文库,还有别的办法吗?多谢各位了!!!
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rioarsenal

金虫 (正式写手)

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1949stone(金币+1): 鼓励 2011-03-19 11:36:54
引用回帖:
Originally posted by szylnl at 2011-03-19 09:51:50:
我现在纯化了一个酵母的蛋白,经过LC-MS-MS分析得知了这个蛋白的很多的氨基酸片段序列,怎么才能得这个蛋白质的基因啊?有文献说构建cDNA文库,还有别的办法吗?多谢各位了!!!

同学,酵母的基因组全序列都测定了吧,去NCBI的数据库检索啊。

用已经获得的蛋白质序列做检索,blastp,看看是什么蛋白,然后去查基因就可以了。
4楼2011-03-19 10:45:55
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

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1949stone(金币+1): 鼓励 2011-03-19 11:36:29
将这些氨基酸序列去NCBI做blast,可以推测出这个蛋白可能是什么蛋白,然后根据该蛋白的基因序列或者保守序列去扩增你的蛋白基因。但是要注意,这个方法虽然简单,但是可行性有很大的运气成分的。
2楼2011-03-19 09:58:15
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

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1949stone(金币+1): 鼓励 2011-03-19 11:36:36
LC-MS分析得知了这个蛋白的很多的氨基酸片段序列.
其实你做不做LC-MS,蛋白都是由氨基酸组成的。
做蛋白组学,貌似除了X衍射就是核磁了。
Thank-you,so-blue.
3楼2011-03-19 10:07:54
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szylnl

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by szylnl at 2011-03-19 09:51:50:
我现在纯化了一个酵母的蛋白,经过LC-MS-MS分析得知了这个蛋白的很多的氨基酸片段序列,怎么才能得这个蛋白质的基因啊?有文献说构建cDNA文库,还有别的办法吗?多谢各位了!!!

我就是按照您说的这个方法做的,可是P不出来啊,
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5楼2011-03-20 09:01:47
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