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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】调取基因
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szylnl

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】调取基因 已有6人参与

我现在纯化了一个酵母的蛋白，经过LC-MS-MS分析得知了这个蛋白的很多的氨基酸片段序列，怎么才能得这个蛋白质的基因啊？有文献说构建cDNA文库，还有别的办法吗？多谢各位了！！！
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用百分之百的努力去做每件事
1楼 2011-03-19 09:51:50
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)
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1949stone(金币+1): 鼓励 2011-03-19 11:36:29
将这些氨基酸序列去NCBI做blast，可以推测出这个蛋白可能是什么蛋白，然后根据该蛋白的基因序列或者保守序列去扩增你的蛋白基因。但是要注意，这个方法虽然简单，但是可行性有很大的运气成分的。
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2楼2011-03-19 09:58:15
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷
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1949stone(金币+1): 鼓励 2011-03-19 11:36:36
LC-MS分析得知了这个蛋白的很多的氨基酸片段序列.
其实你做不做LC-MS，蛋白都是由氨基酸组成的。
做蛋白组学，貌似除了X衍射就是核磁了。
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Thank-you，so-blue.
3楼2011-03-19 10:07:54
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rioarsenal

金虫 (正式写手)
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1949stone(金币+1): 鼓励 2011-03-19 11:36:54
引用回帖:
Originally posted by szylnl at 2011-03-19 09:51:50:
我现在纯化了一个酵母的蛋白，经过LC-MS-MS分析得知了这个蛋白的很多的氨基酸片段序列，怎么才能得这个蛋白质的基因啊？有文献说构建cDNA文库，还有别的办法吗？多谢各位了！！！

同学，酵母的基因组全序列都测定了吧，去NCBI的数据库检索啊。

用已经获得的蛋白质序列做检索，blastp，看看是什么蛋白，然后去查基因就可以了。
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4楼2011-03-19 10:45:55
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szylnl

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by szylnl at 2011-03-19 09:51:50:
我现在纯化了一个酵母的蛋白，经过LC-MS-MS分析得知了这个蛋白的很多的氨基酸片段序列，怎么才能得这个蛋白质的基因啊？有文献说构建cDNA文库，还有别的办法吗？多谢各位了！！！

我就是按照您说的这个方法做的，可是P不出来啊，
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用百分之百的努力去做每件事
5楼2011-03-20 09:01:47
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)
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引用回帖:
Originally posted by rioarsenal at 2011-03-19 10:45:55:
同学，酵母的基因组全序列都测定了吧，去NCBI的数据库检索啊。

用已经获得的蛋白质序列做检索，blastp，看看是什么蛋白，然后去查基因就可以了。

同rioarsenal同学意见一样！
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jiayoubashaonian
6楼2011-03-20 09:04:30
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2011ylcao
引用回帖:
Originally posted by blackrose8089 at 2011-03-20 09:04:30:
同rioarsenal同学意见一样！

7楼2011-03-20 09:40:59
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szylnl

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by rioarsenal at 2011-03-19 10:45:55:
同学，酵母的基因组全序列都测定了吧，去NCBI的数据库检索啊。

用已经获得的蛋白质序列做检索，blastp，看看是什么蛋白，然后去查基因就可以了。

首先谢谢您，可是我已经比对过了，同源性都很低，只有几条肽段有重复，需要怎么办啊 ？谢谢
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用百分之百的努力去做每件事
8楼2011-03-20 21:49:47
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