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shengxiang

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】请教如何使用GROMACS做PMF?已有6人参与

请教如何使用GROMACS做PMF?有做过的还望不吝赐教~~~
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Youngchsh

木虫 (正式写手)

Gerrard

没有遇到过,等待高人
原来木虫还挺有意思的
2楼2011-03-12 15:03:16
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superdirac

木虫 (正式写手)

★ ★
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-03-23 12:45:32
umbrella sample.

 不过,我用的是namd。  计算pmf,用ABF。
我认为,酒一口一口喝,路一步一步走~步子迈大了,喀~容易扯着蛋
3楼2011-03-23 10:28:17
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shengxiang

木虫 (著名写手)

哦啊  那我去试试 谢谢你了
4楼2011-03-24 08:56:18
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fantastic

银虫 (著名写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
gromacs有个教程就是做PMF的,上去看看吧!
5楼2011-04-12 16:08:42
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shengxiang

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by fantastic at 2011-04-12 16:08:42:
gromacs有个教程就是做PMF的,上去看看吧!

是吗?那我看看去,能给下网址吗?
6楼2011-04-13 09:18:37
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fantastic

银虫 (著名写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-04-13 15:51:20
引用回帖:
Originally posted by shengxiang at 2011-04-13 09:18:37:
是吗?那我看看去,能给下网址吗?

gromacs的官网上面的,你google一下就出来了
7楼2011-04-13 11:09:02
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jackwangee

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
御剑江湖(金币+3): good 2011-12-21 18:52:34
8楼2011-12-21 10:28:45
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476992939

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
998076楼: Originally posted by superdirac at 2011-03-23 10:28:17:
umbrella sample.

 不过,我用的是namd。  计算pmf,用ABF。

具体用namd怎么计算PMF呢?
9楼2012-03-29 09:08:05
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