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[交流] 【求助】过渡态没有势垒的情况

初始态和终态都已经经过弛豫计算，但是计算过渡态的时候发现没有势垒，这时候应该怎么处理？是认为原来的一个态不稳定呢还是重新计算呢？

我用的VASP，CNEB的代码

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1楼 2011-02-28 22:38:11

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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

★
zzy870720z(金币+1): 谢谢参与讨论 2011-03-01 08:32:17
bingmou(金币+1): 2011-03-01 10:14:48
bingmou:编辑内容 2011-03-01 10:16

并不是所有“反应”都有能垒的。个人觉得没有能垒的情况直接用NEB就好了，用Cl-NEB可能不收敛。

如果没有势垒，那岂不是初始态或者终态有一个是不稳定的，特别是两个本来就有能量差的时候。
我用的都是CI-NEB,幸运的是都收敛的

[ Last edited by bingmou on 2011-3-1 at 10:16 ]

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2楼2011-02-28 23:14:24

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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

这个有意思。呵呵

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5楼2011-03-01 11:06:15

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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

★ ★ ★
ellsaking(金币+3): 谢谢说明 2011-03-01 13:52:29
bingmou(金币+1): 2011-03-01 14:49:56

有两种情况：
（1）比如化学吸附，这个是自然发生的事情。气相分子到固体表面的吸附，很可能就没有能垒。计算这个过程，往往只是需要确认一下，看是不是真的没有能垒。
（2）能垒很小或者不明显的情况。如果没有做分子动力学而直接结构优化，可能错过了全局能量最小点。这个是计算程序失败的情况造成的，初始构象没有找好。

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7楼2011-03-01 13:40:54

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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢提示 2011-03-15 08:34:49

引用回帖:

Originally posted by sunyang1988 at 2011-03-04 18:47:34:
这个分子动力学找到一个比较合理的初始结构，一般用什么软件呢

vasp就可以。但是可以偷偷用用dmol。呵呵。或者adsorption locator。但是力场可能不全，特别是对slab结构。

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19楼2011-03-14 22:32:31

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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:

Originally posted by franch at 2011-04-06 20:57:44:
哪些情况要先做分子动力学？

实际上这个，很难。我自己尝试过，没有作出什么东西来。

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21楼2011-04-06 21:00:57

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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

23楼: Originally posted by wujing110 at 2011-09-27 10:28:20:
请问下，我刚刚开始做NEB
做了有4个 images，00-05文件夹，只有01-04里面的东西很多
00,05里面只有POSCAR
收敛了
处理数据的时候提示00文件夹里面没有OUTCAR
请各位高手指点下我这只小菜

00 05里面的要单独计算scf，就会得到OUTCAR.

NEB收敛后，建议再对每一个image计算一次scf.

NEB计算的时候一般是一个K点。scf计算总能的时候，可以加密k点。00-05的scf总能计算统一KPOINTS和INCAR.

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24楼2011-09-27 11:37:22

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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

25楼: Originally posted by wujing110 at 2011-09-27 11:57:38:
谢谢前辈
那我想问下NEB收敛后，建议再对每一个image计算一次scf.
计算一次scf是分别在01,02,03,04文件夹下面进行么？那原先01,02,03,04文件夹里面有OUTCAR之类的一些文件怎么办？

原来的存档就好。后面的用来整理数据发论文。

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26楼2011-09-27 12:33:57

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我现在也碰到没有能垒的情况。不知道怎么解释。

看是否需要做修正呢？

需要考虑修正的情况我可以列举以下几条：

（1）NEB计算是Gamma点的，真要计算能垒的时候，需要考虑加密K点，与端点scf计算K设置一样；
（2）零点能修正，但是这个对过渡态（如果有）有降低能垒效果；
（3）偶极修正，如果slab或者其它结构不对称。
（4）色散力修正。这个对slab表面吸附小分子不同覆盖度下的吸附能可能影响较大。

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27楼2011-09-27 19:12:17

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