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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【讨论】如何判断所画的分子结构是否重复？
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bbslover

金虫 (正式写手)

[交流] 【讨论】如何判断所画的分子结构是否重复？ 已有4人参与

我们做计算的时候，往往用chemdraw画出分子结构，有时多达几百个结构，由于是在不同文献中出现的结构，所以难免会画出重复的结构，各位我们是如何快速找出重复的结构呢？

不可能一个一个看吧？ 看不过来，各位快给出快速去除重复结构的办法吧，谢谢
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1楼 2011-02-26 10:08:42
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-02-28 13:53:06
QSAR时候常用一个拓扑指数, 可以满足你的要求
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2楼2011-02-26 11:00:49
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bamboosity

木虫 (著名写手)
★ ★
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zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-02-26 22:52:31
DS, Pipline等软件都可以去重的，一步到位！
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3楼2011-02-26 20:45:01
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bbslover

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bay__gulf at 2011-02-26 11:00:49:
QSAR时候常用一个拓扑指数, 可以满足你的要求

多谢帮助，但是拓扑描述符包括很多种，再请教一下 拓扑指数 具体指的是那一种呢？

比如说 dragon的拓扑描述符中的哪个呢？


谢谢了！
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4楼2011-02-27 09:28:35
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bbslover

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bamboosity at 2011-02-26 20:45:01:
DS, Pipline等软件都可以去重的，一步到位！

多谢回复，能不能指点一下，怎么用ds去重复，是不是把包含所有结构的sdf格式的文件数据ds中，然后再进行一下设置，就可以了，还是有其他的操作，谢谢帮助！
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5楼2011-02-27 09:48:08
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
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ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-02-28 13:53:16
可以用分子量排序，如果有一样的，你就看看，然后手工删除，很简单呀。
赞一下(2人) 回复此楼
除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
6楼2011-02-27 14:18:57
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bbslover

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2011-02-27 14:18:57:
可以用分子量排序，如果有一样的，你就看看，然后手工删除，很简单呀。

多谢了，我试试看。 分子多，很麻烦。
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7楼2011-02-28 07:47:35
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-02-28 13:53:23
还可以加上分子式检索，分子量一样，分子式一样，可能性有95%了。
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除了你的亲人，没有人应该对你好，对你好的人，一定要珍惜。
8楼2011-02-28 09:48:41
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bbslover

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2011-02-28 09:48:41:
还可以加上分子式检索，分子量一样，分子式一样，可能性有95%了。

好的 多谢了
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9楼2011-02-28 17:29:15
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