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yxcai

铁杆木虫 (著名写手)

应助: 8 (幼儿园)
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红花: 15
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在线: 666.5小时
虫号: 150399
注册: 2005-12-29
专业: 凝聚态物性I:结构、力学和

[交流] 求助】vasp计算速度问题----相同CPU 已有8人参与

在我自己服务器上的每一电子步时间如下：

POTLOK:  VPU time 10.08: CPU time 58.46
SETDIJ:  VPU time 5.17: CPU time 33.22
EDDIAG:  VPU time 63.87: CPU time 74.08
  RMM-DIIS:  VPU time  101.21: CPU time  107.23
ORTHCH:  VPU time 19.62: CPU time 19.45
DOS :  VPU time 0.00: CPU time 0.00
CHARGE:  VPU time 32.30: CPU time 31.97
MIXING:  VPU time 0.24: CPU time 0.24
------------------------------------------
   LOOP:  VPU time  232.98: CPU time  325.22

在别人集群上的每一电子步时间如下：
POTLOK:  VPU time 1.79: CPU time 1.79
SETDIJ:  VPU time 0.95: CPU time 0.96
EDDIAG:  VPU time 24.09: CPU time 24.11
  RMM-DIIS:  VPU time 28.17: CPU time 28.20
ORTHCH:  VPU time 4.98: CPU time 4.98
DOS :  VPU time 0.00: CPU time 0.00
CHARGE:  VPU time 7.95: CPU time 7.95
MIXING:  VPU time 0.10: CPU time 0.10
------------------------------------------
   LOOP:  VPU time 68.04: CPU time 68.09

CPU都是至强5520，都是2U 8核，内存都是16G，体系150个原子左右，为什么我的时间这么长？速度差至少一倍。
尤其是：
EDDIAG:  VPU time 63.87: CPU time 74.08
  RMM-DIIS:  VPU time  101.21: CPU time  107.23

都用的是intel数学库。计算速度到底由什么决定的？为何差异如此巨大？

[ Last edited by yxcai on 2011-2-23 at 20:47 ]

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1楼 2011-02-23 20:40:32

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yxcai

铁杆木虫 (著名写手)

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引用回帖:

Originally posted by zzy870720z at 2011-02-24 11:44:25:
这就奇怪了，不太明白

下面是集群上使用的MKL和编译器

source /opt/intel/Compiler/11.0/081/bin/iccvars.sh intel64
source /opt/intel/Compiler/11.0/081/bin/ifortvars.sh intel64
source /opt/intel/mpi-rt/3.2.1/bin64/mpivars.sh
source /opt/intel/mkl/10.1.2.024/tools/environment/mklvarsem64t.sh
export I_MPI_DEVICE=ssm

我的电脑上也是，而且我使用过MPICH也换过OPENMPI，影响很小。