24小时热门版块排行榜    

查看: 3124  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yxcai

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 求助】vasp计算速度问题----相同CPU 已有8人参与

在我自己服务器上的每一电子步时间如下:

   POTLOK:  VPU time   10.08: CPU time   58.46
    SETDIJ:  VPU time    5.17: CPU time   33.22
    EDDIAG:  VPU time   63.87: CPU time   74.08
  RMM-DIIS:  VPU time  101.21: CPU time  107.23
    ORTHCH:  VPU time   19.62: CPU time   19.45
    DOS   :  VPU time    0.00: CPU time    0.00
    CHARGE:  VPU time   32.30: CPU time   31.97
    MIXING:  VPU time    0.24: CPU time    0.24
    ------------------------------------------
      LOOP:  VPU time  232.98: CPU time  325.22


在别人集群上的每一电子步时间如下:
   POTLOK:  VPU time    1.79: CPU time    1.79
   SETDIJ:  VPU time    0.95: CPU time    0.96
   EDDIAG:  VPU time   24.09: CPU time   24.11
  RMM-DIIS:  VPU time   28.17: CPU time   28.20
   ORTHCH:  VPU time    4.98: CPU time    4.98
    DOS   :  VPU time    0.00: CPU time    0.00
    CHARGE:  VPU time    7.95: CPU time    7.95
    MIXING:  VPU time    0.10: CPU time    0.10
    ------------------------------------------
     LOOP:  VPU time   68.04: CPU time   68.09


CPU都是至强5520, 都是2U 8核,内存都是16G,体系150个原子左右,为什么我的时间这么长?速度差至少一倍。
尤其是:
   EDDIAG:  VPU time   63.87: CPU time   74.08
  RMM-DIIS:  VPU time  101.21: CPU time  107.23

都用的是intel数学库。计算速度到底由什么决定的?为何差异如此巨大?

[ Last edited by yxcai on 2011-2-23 at 20:47 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yxcai

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2011-02-24 11:44:25:
这就奇怪了,不太明白

下面是集群上使用的MKL和编译器

source /opt/intel/Compiler/11.0/081/bin/iccvars.sh intel64
source /opt/intel/Compiler/11.0/081/bin/ifortvars.sh intel64
source /opt/intel/mpi-rt/3.2.1/bin64/mpivars.sh
source /opt/intel/mkl/10.1.2.024/tools/environment/mklvarsem64t.sh
export I_MPI_DEVICE=ssm



我的电脑上也是,而且我使用过MPICH也换过OPENMPI,影响很小。
6楼2011-02-24 11:56:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-02-24 09:18:48
编译器都一样嘛,编译也都一样?
博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2011-02-23 21:24:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yxcai

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2011-02-23 21:24:41:
编译器都一样嘛,编译也都一样?

都是intel的编译器
3楼2011-02-24 11:08:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

youzhizhe: 谢谢参与。 2011-02-24 12:01:12
引用回帖:
Originally posted by yxcai at 2011-02-24 11:08:48:
都是intel的编译器

这就奇怪了,不太明白
博学、审问、慎思、明辨、笃学
5楼2011-02-24 11:44:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +12 羊腰板 2026-08-21 12/600 2026-08-23 07:40 by ma0526
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +4 简单化xn 2026-08-22 8/400 2026-08-23 07:20 by ilovexiaobin
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 10/500 2026-08-23 07:17 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 zjuhero 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见