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yxcai铁杆木虫 (著名写手)
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[交流]
求助】vasp计算速度问题----相同CPU 已有8人参与
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在我自己服务器上的每一电子步时间如下： POTLOK: VPU time 10.08: CPU time 58.46 SETDIJ: VPU time 5.17: CPU time 33.22 EDDIAG: VPU time 63.87: CPU time 74.08 RMM-DIIS: VPU time 101.21: CPU time 107.23 ORTHCH: VPU time 19.62: CPU time 19.45 DOS : VPU time 0.00: CPU time 0.00 CHARGE: VPU time 32.30: CPU time 31.97 MIXING: VPU time 0.24: CPU time 0.24 ------------------------------------------ LOOP: VPU time 232.98: CPU time 325.22 在别人集群上的每一电子步时间如下： POTLOK: VPU time 1.79: CPU time 1.79 SETDIJ: VPU time 0.95: CPU time 0.96 EDDIAG: VPU time 24.09: CPU time 24.11 RMM-DIIS: VPU time 28.17: CPU time 28.20 ORTHCH: VPU time 4.98: CPU time 4.98 DOS : VPU time 0.00: CPU time 0.00 CHARGE: VPU time 7.95: CPU time 7.95 MIXING: VPU time 0.10: CPU time 0.10 ------------------------------------------ LOOP: VPU time 68.04: CPU time 68.09 CPU都是至强5520， 都是2U 8核，内存都是16G，体系150个原子左右，为什么我的时间这么长？速度差至少一倍。 尤其是： EDDIAG: VPU time 63.87: CPU time 74.08 RMM-DIIS: VPU time 101.21: CPU time 107.23 都用的是intel数学库。计算速度到底由什么决定的？为何差异如此巨大？ [ Last edited by yxcai on 2011-2-23 at 20:47 ] |
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下面是集群上使用的MKL和编译器 source /opt/intel/Compiler/11.0/081/bin/iccvars.sh intel64 source /opt/intel/Compiler/11.0/081/bin/ifortvars.sh intel64 source /opt/intel/mpi-rt/3.2.1/bin64/mpivars.sh source /opt/intel/mkl/10.1.2.024/tools/environment/mklvarsem64t.sh export I_MPI_DEVICE=ssm 我的电脑上也是，而且我使用过MPICH也换过OPENMPI，影响很小。 |
6楼2011-02-24 11:56:33
