| 查看: 684 | 回复: 1 | |||
[交流]
【求助】VASP计算出错--新年第一帖
|
|
首先祝虫子们新年快乐啊。 我的计算环境如下： 我有两个Nodes，是HP的BL460c G7，配置是 Intel X5670 24G内存，两块20G的网卡。 我安装的系统的Debian-Lenny, 64bits 编译器是Intel的icc,ifort和MKL（version-11), 以及MPICH2。我已经 安装好VASP，才用Bewulf结构，但是计算中出现了问题： 1.如果我只在一个node上做计算（只启动一个node），采用mpirun，可以全速计算，MPI不会出现问题： 2.但是假如我同事启动两个，node0和node1（也就是两个node有数据交流时，不管用的核多少），我使用mpirun时，当POSCAR 或者说计算的super cell超过一定值时，就会报如下的错： ################################################### Fatal error in MPI_Waitall: Other MPI error, error stack: MPI_Waitall(261)..................: MPI_Waitall(count=46, req_array=0x7fffeeca46a0, status_array=0x7fffeeca4760) failed MPIDI_CH3I_Progress(150)..........: MPID_nem_mpich2_blocking_recv(948): MPID_nem_tcp_connpoll(1709).......: Communication error rank 23 in job 1 node0_55860 caused collective abort of all ranks exit status of rank 23: killed by signal 9 ###################################################举个例子,VASP的例子，关于水的优化： O atom in a box 1.0 ! universal scaling parameters 8.0 0.0 0.0 ! lattice vector a(1) 0.0 8.0 0.0 ! lattice vector a(2) 0.0 0.0 8.0 ! lattice vector a(3) 1 ! number of atoms cart ! positions in cartesian coordinates 0 0 0 当 “1.0 ! universal scaling parameters”，时，同时在两个nodes上计算（也就是两个node有数据交流时）会出错的，但是在一个node上不会。 但是当把“1.0 ! universal scaling parameters”中的“1”修改成0.5时，就不会。 我也测试过不管怎么样，当supercell超过4，就会出错。 我想这可能是我编译VASP时有问题啦，那位虫子能给点建议嘛？谢谢。。。  |
回复此楼» 猜你喜欢
环境调剂
已经有4人回复
-
272求调剂
已经有9人回复
-
290分材料工程085601求调剂 数二英一
已经有5人回复
-
0856材料求调剂
已经有13人回复
-
材料学硕318求调剂
已经有10人回复
-
材料270求调剂
已经有7人回复
-
0856求调剂285
已经有11人回复
-
085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂
已经有11人回复
-
材料284求调剂，一志愿郑州大学英一数二专硕
已经有15人回复
-
理学，工学，农学调剂，少走弯路，这里欢迎您！
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- vasp5.2计算误差太大
已经有11人回复
- VASP 磁性BerryPhase计算问题（Berryphase异常大）
已经有3人回复
- VASP计算：如何处理波函数占用空间太大的问题
已经有5人回复
- vasp 并行运算出错
已经有7人回复
- vasp计算静态出现错误！
已经有5人回复
- vasp计算在进行静态计算时，出错。
已经有3人回复
- 【求助】vasp计算出错，不知道问题出在哪里
已经有5人回复
- 【求助】vasp计算过渡态结果出错
已经有17人回复
- 【求助】VASP 计算磁学性质时出现错误
已经有3人回复
- 【求助】使用vasp进行带心冻结声子计算的几个问题~~~
已经有9人回复
- 【求助】vasp5 光学计算结果问题
已经有4人回复
- 【求助】vasp静态计算能量值错误
已经有21人回复
- 【求助】用vasp计算磁矩的问题
已经有13人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
湖南大学材料院陶益杰老师招收2026年秋季入学博士生一名
+1/173
-
有机
+1/100
-
王志博教授课题组招收调剂硕士研究生
+1/81
-
课题组宣传
+1/42
-
中煤科工生态环境科技有限公司招聘植物学相关科研人员1人
+2/40
-
华中科技大学材料学院国家级人才团队招收2026年硕士研究生
+1/35
-
大连工业大学杰青/长江团队招收储能电池方向博士
+1/34
-
青岛科技大学2026年高分子材料方向科研助理招聘
+1/32
-
look 26届 || 计算机、电子信息类、电科、控制、通信考研T j信息醇：1o33 7747 o3
+1/20
-
青岛大学招收硕士调剂
+1/12
-
齐鲁工业大学轻工学部、绿色造纸与资源循环全国重点实验室招收一志愿或调剂研究生
+1/10
-
26届计算机、电子信息类、电科、控制、通信考研T j信息pp骏：74+08+76+6+20》
+1/8
-
“教育部长江学者和创新团队发展计划”入选团队招收材料，化学与化工博士研究生
+1/7
-
look 26届计算机、电子信息类、电科、控制、通信考研T j信息醇：10+33+77+47+03
+1/7
-
中国科学院大学杭州高等研究院 胶体量子点材料与器件方向 博士后招聘
+1/7
-
26届计算机、电子信息类、电科、控制、通信考研T j信息pp骏：74+08+76+6+20>
+1/5
-
354求捞085400
+1/4
-
国家级人才护航，省重点平台赋能，卢宝阳教授课题组诚邀有志学子共筑科研新辉煌！
+1/1
-
26届计算机、电子信息类、电科、控制、通信考研T j信息pp骏：74+08+76+6+20
+1/1
-
北京纳米能源与系统研究所 王中林院士/曹南颖研究员课题组招收2026硕士研究生1-2名
+1/1
2楼2011-02-08 13:41:59
