| 查看: 740 | 回复: 1 | |||
[交流]
【求助】VASP计算出错--新年第一帖
|
|
首先祝虫子们新年快乐啊。 我的计算环境如下： 我有两个Nodes，是HP的BL460c G7，配置是 Intel X5670 24G内存，两块20G的网卡。 我安装的系统的Debian-Lenny, 64bits 编译器是Intel的icc,ifort和MKL（version-11), 以及MPICH2。我已经 安装好VASP，才用Bewulf结构，但是计算中出现了问题： 1.如果我只在一个node上做计算（只启动一个node），采用mpirun，可以全速计算，MPI不会出现问题： 2.但是假如我同事启动两个，node0和node1（也就是两个node有数据交流时，不管用的核多少），我使用mpirun时，当POSCAR 或者说计算的super cell超过一定值时，就会报如下的错： ################################################### Fatal error in MPI_Waitall: Other MPI error, error stack: MPI_Waitall(261)..................: MPI_Waitall(count=46, req_array=0x7fffeeca46a0, status_array=0x7fffeeca4760) failed MPIDI_CH3I_Progress(150)..........: MPID_nem_mpich2_blocking_recv(948): MPID_nem_tcp_connpoll(1709).......: Communication error rank 23 in job 1 node0_55860 caused collective abort of all ranks exit status of rank 23: killed by signal 9 ###################################################举个例子,VASP的例子，关于水的优化： O atom in a box 1.0 ! universal scaling parameters 8.0 0.0 0.0 ! lattice vector a(1) 0.0 8.0 0.0 ! lattice vector a(2) 0.0 0.0 8.0 ! lattice vector a(3) 1 ! number of atoms cart ! positions in cartesian coordinates 0 0 0 当 “1.0 ! universal scaling parameters”，时，同时在两个nodes上计算（也就是两个node有数据交流时）会出错的，但是在一个node上不会。 但是当把“1.0 ! universal scaling parameters”中的“1”修改成0.5时，就不会。 我也测试过不管怎么样，当supercell超过4，就会出错。 我想这可能是我编译VASP时有问题啦，那位虫子能给点建议嘛？谢谢。。。  |
回复此楼» 猜你喜欢
航天502所 高瑛珂博士 婚内征婚 欺骗女性开房
已经有14人回复
-
地球科学部D01口青年基金，最低几A几B几C才能有几率中呀。
已经有3人回复
-
投稿文章被秒拒了
已经有4人回复
-
招收2026级博士生
已经有6人回复
-
宿州学院学报
已经有5人回复
-
博士申请
已经有5人回复
-
西安交大新媒学院副院长用撤稿论文结题
已经有7人回复
-
论文撤稿了
已经有9人回复
-
化学专业申博
已经有5人回复
-
医学类期刊求推荐
已经有6人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- vasp5.2计算误差太大
已经有11人回复
- VASP 磁性BerryPhase计算问题（Berryphase异常大）
已经有3人回复
- VASP计算：如何处理波函数占用空间太大的问题
已经有5人回复
- vasp 并行运算出错
已经有7人回复
- vasp计算静态出现错误！
已经有5人回复
- vasp计算在进行静态计算时，出错。
已经有3人回复
- 【求助】vasp计算出错，不知道问题出在哪里
已经有5人回复
- 【求助】vasp计算过渡态结果出错
已经有17人回复
- 【求助】VASP 计算磁学性质时出现错误
已经有3人回复
- 【求助】使用vasp进行带心冻结声子计算的几个问题~~~
已经有9人回复
- 【求助】vasp5 光学计算结果问题
已经有4人回复
- 【求助】vasp静态计算能量值错误
已经有21人回复
- 【求助】用vasp计算磁矩的问题
已经有13人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
丹麦技术大学招聘食品微生物学博士一名-全奖高薪，三年毕业，月薪约2.4w 人民币
+1/584
-
坐标北京，诚征女友
+2/382
-
南京大学 智能驱动与感知材料实验室 诚招推免硕生生/直博生/博士生/科研助理/博士后
+1/134
-
中科院深圳先进技术研究院集成电路先进封装博士后招聘
+1/80
-
诚邀津门师者共研
+1/74
-
真诚才是必杀技
+1/62
-
【通知】北京信息科技大学仪器科学与光电工程学院招收调剂生（2026），快来报名吧！
+1/33
-
坐标广州
+2/26
-
博士申请
+1/25
-
哈尔滨工业大学/院士团队招收 硕士、博士
+1/20
-
紧急招收2026年秋季入学博士生1名（湘潭大学 固体废弃物低碳利用湖南省工程研究中心）
+1/11
-
紧急招收2026年秋季入学博士生1名（湘潭大学 固体废弃物低碳利用湖南省工程研究中心）
+1/8
-
吸波粉体电磁参数模具加工
+1/8
-
【博士招生】武汉科技大学招收材料、化工、环境、冶金类2026年“申请-考核”制博士生
+1/8
-
材料分析测试
+1/6
-
电子科技大学材料学院SFT创新中心招收准备考硕和读博的科研助理 理工医交叉方向
+1/4
-
读博申请无机纳米材料方向
+1/3
-
【通知】北京信息科技大学仪器科学与光电工程学院招收博士研究生（2026），报名吧！
+1/2
-
中山大学-柔性电子方向-博士研究生招生
+1/2
-
（26年博士补录，满足要求可提前毕业）材料/化学 温州大学化学与材料工程学院
+1/2
2楼2011-02-08 13:41:59