| 查看: 1781 | 回复: 2 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[交流]
【求助】关于用DS药效团筛选数据库的问题
|
||||
|
用建好的药效团筛选小分子数据库 遇到的问题 利用DS中的search 3D database 模块 进行筛选 以DS中自带的Minimaybridge数据库为例 参数默认，其中Maximum Hits 为300。 筛选得到300个分子，FitValue从6.97到0。 把Maximum Hits 改为 100 ， 筛选得到100个分子，FitValue从 6.97到0.001 再次把Maximum Hits 改为 1000， 筛选得到782个分子，FitValue从 7.48到0 问题一：Maximum Hits 设置的不同，得到的结果差异很大。同一个分子在上述三种情况下的FitValue可能是不一样的，那我如何筛选化合物？对于不同大小的数据库，Maximum Hits 该怎么设置？ 还有个现象：Minimaybridge数据库中编号是以A-Z的顺序排列的 Maximum Hits 为100时，得到的化合物编号是从AW--BTB Maximum Hits 为300，得到的化合物编号是从AW--JFD Maximum Hits 为1000，得到的化合物编号是从AW--XAX。 问题二：DS好像只会把符合某一药效团的前Maximum Hits（100,300,1000）数量的化合物筛选出来 ；并不是我一开始理解的对数据库中所有分子进行匹配，然后根据FitValue值进行排列。该如何操作，能让DS筛选数据库中每个分子对其FitValue进行排列？？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Discovery Studio 常见问题及使用教程 |
» 猜你喜欢
上海工程技术大学【激光智能制造】课题组招收硕士
已经有6人回复
-
带资进组求博导收留
已经有11人回复
-
自荐读博
已经有5人回复
-
求个博导看看
已经有16人回复
-
上海工程技术大学张培磊教授团队招收博士生
已经有4人回复
-
求助院士们，这个如何合成呀
已经有4人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有9人回复
-
写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？
已经有6人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有11人回复
-
中科院杭州医学所招收博士生一名（生物分析化学、药物递送）
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于特别资助学校筛选的问题
已经有5人回复
- 关于细胞筛选的问题
已经有1人回复
- 生成药效团时，化合物的手性问题
已经有7人回复
- 【求助/交流】关于微生物筛选的一些问题，需要各位帮助~
已经有17人回复
- 【求助】计算机辅助药物设计
已经有9人回复
- 【求助】请问关于土壤团聚体的筛选问题？
已经有6人回复
- 【求助】DS里药效团验证分析
已经有6人回复
- 【求助】DS2.5学习中关于药效团构建的问题
已经有7人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
南京都市圈高校大龄离异博士征友
+2/522
-
湖南师范大学医工交叉科研团队招收博士研究生
+1/174
-
【CSC招生】拉瓦尔大学流体力学博士项目
+3/141
-
新年快乐！祝各位诸事顺遂！
+1/83
-
广州
+1/70
-
2026博士申请——有机化学\计算化学\药物化学方向
+1/53
-
浙江师范大学申利国教授招聘博士后研究人员
+1/46
-
衡水学院招收食品与营养方向联合培养研究生
+1/36
-
浙江师范大学申利国教授招聘博士后研究人员
+1/29
-
暨南大学理工学院 光子技术研究院段宣明团队申请制读博招生
+1/29
-
山东大学集成电路学院博士招生1名
+1/12
-
哈尔滨工业大学招收硕士研究生（欢迎环境、市政、生物、化学、农业等专业，长期有效）
+1/11
-
长春工业大学机电工程学院韩玲教授招收审核制2026年秋季入学博士生
+1/6
-
博士生招生, 南京大学材料物理
+1/5
-
沈阳化工大学资源化工与材料教育部重点实验室能源催化方向招收2026年入学博士研究生。
+1/4
-
山东大学集成电路学院博士招生1名
+1/2
-
山东大学集成电路学院博士招生1名
+1/2
-
北京师范大学与企业联合招聘博士后、全职、兼职人员
+1/1
-
探究TGF-β在癌症免疫调控中的作用机制|肿瘤
+1/1
-
【博士招生】AI+材料/能源及海上能源岛方向有若干申请考核制名额
+1/1
3楼2011-09-05 19:53:28
2楼2011-02-09 11:19:19