| 查看: 1873 | 回复: 2 | ||||
[交流]
【求助】关于用DS药效团筛选数据库的问题
|
|
用建好的药效团筛选小分子数据库 遇到的问题 利用DS中的search 3D database 模块 进行筛选 以DS中自带的Minimaybridge数据库为例 参数默认,其中Maximum Hits 为300。 筛选得到300个分子,FitValue从6.97到0。 把Maximum Hits 改为 100 , 筛选得到100个分子,FitValue从 6.97到0.001 再次把Maximum Hits 改为 1000, 筛选得到782个分子,FitValue从 7.48到0 问题一:Maximum Hits 设置的不同,得到的结果差异很大。同一个分子在上述三种情况下的FitValue可能是不一样的,那我如何筛选化合物?对于不同大小的数据库,Maximum Hits 该怎么设置? 还有个现象:Minimaybridge数据库中编号是以A-Z的顺序排列的 Maximum Hits 为100时,得到的化合物编号是从AW--BTB Maximum Hits 为300,得到的化合物编号是从AW--JFD Maximum Hits 为1000,得到的化合物编号是从AW--XAX。 问题二:DS好像只会把符合某一药效团的前Maximum Hits(100,300,1000)数量的化合物筛选出来 ;并不是我一开始理解的对数据库中所有分子进行匹配,然后根据FitValue值进行排列。该如何操作,能让DS筛选数据库中每个分子对其FitValue进行排列?? |
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
Discovery Studio 常见问题及使用教程 |
» 猜你喜欢
窗边初夏的小雨
已经有6人回复
2026年申博-电池方向
已经有11人回复
26年申博自荐-计算机视觉
已经有4人回复
导师各种操作恶心咋办
已经有8人回复
2026博士申请求助
已经有5人回复
研究生做的很差,你们会让毕业吗?
已经有11人回复
求碳排放博导;方向是LCA、生命周期可持续发展以及碳排放
已经有7人回复
2026博士或科研助理转27年博士
已经有7人回复
国自科送审了吗
已经有11人回复
博士招生
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
关于特别资助学校筛选的问题
已经有5人回复
关于细胞筛选的问题
已经有1人回复
生成药效团时,化合物的手性问题
已经有7人回复
【求助/交流】关于微生物筛选的一些问题,需要各位帮助~
已经有17人回复
【求助】计算机辅助药物设计
已经有9人回复
【求助】请问关于土壤团聚体的筛选问题?
已经有6人回复
【求助】DS里药效团验证分析
已经有6人回复
【求助】DS2.5学习中关于药效团构建的问题
已经有7人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
广西诚征女友
+1/253
安徽农业大学,农业工程专业博士研究生招生
+2/102
浙江农林大学2026年林业博士生招生,报名截止时间为2026年5月17日。
+1/84
河南师范大学水产学院博士招生
+1/81
太行山徒步之凌水河(一)
+1/79
南方科技大学物理系 CSLM Lab 招生招聘 (软物质/生物物理,Physics of AI)
+1/46
谷歌学术引用量增长
+1/42
谷歌学术引用量增长
+1/40
苏州科技大学国家高层次青年人才团队诚聘副教授/讲师(事业编)和科研助理数名
+1/33
北京航空航天大学拟招收2026博士研究生
+1/31
山东中医药大学2026年招聘有机化学、药物化学等相关方向师资博士后
+1/31
松山湖材料实验室-大连理工大学联合招收博士研究生
+1/29
请教:国际会议报账的问题
+1/17
昆明理工大学余富朝团队2026年诚招有机化学/生物化学等方向“申请-审核”博士研究生
+1/15
北京师范大学珠海校区胡德平课题组招生-理论与计算化学方向-2027秋季入学
+1/14
暨南大学中医学院邓力课题组博士后招聘【中西医结合/交叉学科方向】
+1/12
北航国家优青万思杰团队招收材料、化学博士一名
+1/8
试遍所有AI写作工具,最终锁定这个组合 Prose + DeepSeek V4 Pro
+1/2
南京大学医学院附属鼓楼医院院士团队招聘博士后、科研助理
+1/1
急招!5.14截止!湖南大学招2026级博士研究生
+1/1
2楼2011-02-09 11:19:19
3楼2011-09-05 19:53:28












回复此楼

