| 查看: 1813 | 回复: 2 | ||||
[交流]
【求助】关于用DS药效团筛选数据库的问题
|
|
用建好的药效团筛选小分子数据库 遇到的问题 利用DS中的search 3D database 模块 进行筛选 以DS中自带的Minimaybridge数据库为例 参数默认,其中Maximum Hits 为300。 筛选得到300个分子,FitValue从6.97到0。 把Maximum Hits 改为 100 , 筛选得到100个分子,FitValue从 6.97到0.001 再次把Maximum Hits 改为 1000, 筛选得到782个分子,FitValue从 7.48到0 问题一:Maximum Hits 设置的不同,得到的结果差异很大。同一个分子在上述三种情况下的FitValue可能是不一样的,那我如何筛选化合物?对于不同大小的数据库,Maximum Hits 该怎么设置? 还有个现象:Minimaybridge数据库中编号是以A-Z的顺序排列的 Maximum Hits 为100时,得到的化合物编号是从AW--BTB Maximum Hits 为300,得到的化合物编号是从AW--JFD Maximum Hits 为1000,得到的化合物编号是从AW--XAX。 问题二:DS好像只会把符合某一药效团的前Maximum Hits(100,300,1000)数量的化合物筛选出来 ;并不是我一开始理解的对数据库中所有分子进行匹配,然后根据FitValue值进行排列。该如何操作,能让DS筛选数据库中每个分子对其FitValue进行排列?? |
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
Discovery Studio 常见问题及使用教程 |
» 猜你喜欢
体制内长辈说体制内绝大部分一辈子在底层,如同你们一样大部分普通教师忙且收入低
已经有7人回复
过年走亲戚时感受到了所开私家车的鄙视链
已经有9人回复
今年春晚有几个节目很不错,点赞!
已经有10人回复
情人节自我反思:在爱情中有过遗憾吗?
已经有10人回复
基金正文30页指的是报告正文还是整个申请书
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
关于特别资助学校筛选的问题
已经有5人回复
关于细胞筛选的问题
已经有1人回复
生成药效团时,化合物的手性问题
已经有7人回复
【求助/交流】关于微生物筛选的一些问题,需要各位帮助~
已经有17人回复
【求助】计算机辅助药物设计
已经有9人回复
【求助】请问关于土壤团聚体的筛选问题?
已经有6人回复
【求助】DS里药效团验证分析
已经有6人回复
【求助】DS2.5学习中关于药效团构建的问题
已经有7人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
大连海事大学轮机学院尚有博士名额
+2/76
一个陌生女人的来信
+1/59
海法大学线上开放日
+1/33
国家级青年人才课题组招收2026级硕士研究生
+1/28
清华大学深圳国际研究生院招聘-博士后(长期有效)
+1/27
海南大学海洋技术与装备学院-科研助理招聘(可读博)膜分离水处理方向
+1/27
2026年天津科技大学“新能源催化与膜材料团队”研究生招生
+1/17
天津医科大学基础医学院张恒课题组博士后招聘
+1/11
上海交通大学-宁波东方理工大学联合培养博士生 – 力学
+1/9
太原理工大学集成电路学院招收2026年博士研究生
+1/8
澳科大招收2026秋纳米医学/生物材料方向全奖博士研究生(3月5日18:00截止)
+1/7
湖南大学-分析检测技术和生物柔性传感器-招收1名博士研究生 (2026年,第二批)
+1/6
华中科技大学/武汉纺织大学联合招收博士后
+1/5
苏州大学招收有机化学(材料)方向博士生,2026年9月入学
+1/5
全奖博士 英国利物浦大学+台湾清华大学 双博士学位
+1/5
26年材料/化学相关专业-博士研究生招生-温州大学化学与材料工程学院(26年秋季入学)
+1/5
英国南安普顿大学禅铎课题组诚招气候动力方向博士后
+1/5
北航-国家级人才团队-诚聘博士后
+1/2
中国科学技术大学 工程科学学院 国家级人才团队 诚聘博士后
+1/1
南京大学能源与资源学院徐加陵课题组招聘:科研助理、硕士生、博士生
+1/1
2楼2011-02-09 11:19:19
3楼2011-09-05 19:53:28













回复此楼

