| 查看: 1839 | 回复: 2 | ||||
[交流]
【求助】关于用DS药效团筛选数据库的问题
|
|
用建好的药效团筛选小分子数据库 遇到的问题 利用DS中的search 3D database 模块 进行筛选 以DS中自带的Minimaybridge数据库为例 参数默认，其中Maximum Hits 为300。 筛选得到300个分子，FitValue从6.97到0。 把Maximum Hits 改为 100 ， 筛选得到100个分子，FitValue从 6.97到0.001 再次把Maximum Hits 改为 1000， 筛选得到782个分子，FitValue从 7.48到0 问题一：Maximum Hits 设置的不同，得到的结果差异很大。同一个分子在上述三种情况下的FitValue可能是不一样的，那我如何筛选化合物？对于不同大小的数据库，Maximum Hits 该怎么设置？ 还有个现象：Minimaybridge数据库中编号是以A-Z的顺序排列的 Maximum Hits 为100时，得到的化合物编号是从AW--BTB Maximum Hits 为300，得到的化合物编号是从AW--JFD Maximum Hits 为1000，得到的化合物编号是从AW--XAX。 问题二：DS好像只会把符合某一药效团的前Maximum Hits（100,300,1000）数量的化合物筛选出来 ；并不是我一开始理解的对数据库中所有分子进行匹配，然后根据FitValue值进行排列。该如何操作，能让DS筛选数据库中每个分子对其FitValue进行排列？？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Discovery Studio 常见问题及使用教程 |
» 猜你喜欢
0854求调剂
已经有9人回复
-
材料工程专业日语生求调剂
已经有6人回复
-
071000生物学，一志愿深圳大学296分，求调剂
已经有6人回复
-
调剂
已经有5人回复
-
本科郑州大学，一志愿华东师范大学282求调剂
已经有12人回复
-
一志愿211，化学学硕，310分，本科重点双非，求调剂
已经有8人回复
-
化工学硕 285求调剂
已经有14人回复
-
312求调剂
已经有17人回复
-
生物调剂
已经有6人回复
-
一志愿哈工大，初试329，求环境科学与工程调剂！
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于特别资助学校筛选的问题
已经有5人回复
- 关于细胞筛选的问题
已经有1人回复
- 生成药效团时，化合物的手性问题
已经有7人回复
- 【求助/交流】关于微生物筛选的一些问题，需要各位帮助~
已经有17人回复
- 【求助】计算机辅助药物设计
已经有9人回复
- 【求助】请问关于土壤团聚体的筛选问题？
已经有6人回复
- 【求助】DS里药效团验证分析
已经有6人回复
- 【求助】DS2.5学习中关于药效团构建的问题
已经有7人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
沈阳化工大学环境与安全工程学院生物与医药类、安全工程类、环境工程类接受调剂
+1/596
-
欢迎调剂佛山大学资源与环境专业硕士
+2/138
-
2026年武汉工程大学千人计划团队招收硕士研究生调剂
+2/52
-
江西理工大学赣南实验室赖朝彬教授团队招收调剂硕士研究生
+1/38
-
研究生调剂招生（44名）
+1/38
-
企业出国访问交流求助
+1/37
-
哈尔滨工业大学化工学院中俄联合办学硕士生招生
+1/22
-
华南师范大学环境学院大分子体系多尺度模拟与实验研究团队招收2026年考研调剂生
+1/20
-
香港科技大学 机器人/生物医学
+1/9
-
上海工程技术大学李聪玲课题组招收调剂生
+1/8
-
重庆工商大学 教育部研究中心招收化工/环境/材料/石油/机械方向2026年调剂研究生
+1/7
-
大连工业大学纺织与材料工程学院超临界流体技术课题组 研究生调剂
+1/7
-
北京高校副校长团队招收机械类，环境类学硕和专硕
+1/6
-
福建理工大学招收专业代码08开头学术型硕士研究生
+1/5
-
烟台大学化学化工学院班庆福课题组招收调剂生
+1/5
-
英国拉夫堡大学博士招生 电池方向
+1/5
-
福建理工大学材料学院招收专业代码08开头学术型硕士研究生
+1/3
-
哈尔滨医科大学李老师课题组招收生物信息学方向博士、硕士研究生
+1/2
-
温州大学招2026年博士研究生（电催化领域）
+1/1
-
西南科技大学国家重点实验室李老师课题组接收材料、化学和化工类研究生调剂
+1/1
2楼2011-02-09 11:19:19
3楼2011-09-05 19:53:28
