| 查看: 1848 | 回复: 2 | ||||
[交流]
【求助】关于用DS药效团筛选数据库的问题
|
|
用建好的药效团筛选小分子数据库 遇到的问题 利用DS中的search 3D database 模块 进行筛选 以DS中自带的Minimaybridge数据库为例 参数默认，其中Maximum Hits 为300。 筛选得到300个分子，FitValue从6.97到0。 把Maximum Hits 改为 100 ， 筛选得到100个分子，FitValue从 6.97到0.001 再次把Maximum Hits 改为 1000， 筛选得到782个分子，FitValue从 7.48到0 问题一：Maximum Hits 设置的不同，得到的结果差异很大。同一个分子在上述三种情况下的FitValue可能是不一样的，那我如何筛选化合物？对于不同大小的数据库，Maximum Hits 该怎么设置？ 还有个现象：Minimaybridge数据库中编号是以A-Z的顺序排列的 Maximum Hits 为100时，得到的化合物编号是从AW--BTB Maximum Hits 为300，得到的化合物编号是从AW--JFD Maximum Hits 为1000，得到的化合物编号是从AW--XAX。 问题二：DS好像只会把符合某一药效团的前Maximum Hits（100,300,1000）数量的化合物筛选出来 ；并不是我一开始理解的对数据库中所有分子进行匹配，然后根据FitValue值进行排列。该如何操作，能让DS筛选数据库中每个分子对其FitValue进行排列？？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Discovery Studio 常见问题及使用教程 |
» 猜你喜欢
接受任何调剂
已经有6人回复
-
22408 312求调剂
已经有26人回复
-
收到复试调剂但是去不了
已经有8人回复
-
260求调剂
已经有5人回复
-
急需调剂
已经有10人回复
-
申博/考博
已经有4人回复
-
化工学硕294分，求导师收留
已经有37人回复
-
求调剂
已经有11人回复
-
一志愿华中农业071010，320求调剂
已经有19人回复
-
304求调剂
已经有7人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于特别资助学校筛选的问题
已经有5人回复
- 关于细胞筛选的问题
已经有1人回复
- 生成药效团时，化合物的手性问题
已经有7人回复
- 【求助/交流】关于微生物筛选的一些问题，需要各位帮助~
已经有17人回复
- 【求助】计算机辅助药物设计
已经有9人回复
- 【求助】请问关于土壤团聚体的筛选问题？
已经有6人回复
- 【求助】DS里药效团验证分析
已经有6人回复
- 【求助】DS2.5学习中关于药效团构建的问题
已经有7人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
科研需求-硫化镍钴精矿样品
+1/399
-
【坐标大连】92年本科男生，寻觅姻缘女生
+5/336
-
欧洲“CO2捕集与加氢催化转化”博士招聘（捷克-德国-斯洛文尼亚三国项目）
+1/89
-
【调剂信息】山东科技大学（青岛校区）材料助剂研究团队招收调剂硕士研究生
+1/87
-
山东航空学院安全工程专业085702第三轮接收研究生调剂，欢迎咨询
+1/83
-
长江大学化工学院化工学硕、专硕最后一批调剂（理学、工学均可）
+1/83
-
江西科技师范大学086生物与医药
+1/40
-
中国科学院深圳先进技术研究院院士团队低维材料方向博士后招聘
+1/39
-
南京林业大学-国家级青年人才团队 招2026级申请考核制博士 （有机合成化学方向）
+1/16
-
招材料相关专业调剂生
+1/10
-
中南林院士团队 招 生物质能源与材料 博士生
+1/9
-
欢迎调剂到郑州轻工业大学材料与化学工程学院
+1/8
-
佛山大学动物科技学院2026年硕士研究生招生调剂公告（第三批）
+1/8
-
省重点实验室招收07专业调剂生，海洋生物专业名额充足
+1/7
-
大连大学—六盘水师范学院联培硕士调剂
+1/7
-
华南师范大学环境学院大分子体系多尺度模拟与实验研究团队招收2026年考研调剂生1名
+1/5
-
南京大学FinTech大模型实验室招募斯坦福国际联培博士生和博士后及科研助理
+1/4
-
基金祈福
+1/4
-
九江学院2026年硕士研究生调剂（086002制药工程）
+1/2
-
中科院地理所招收地理学土地资源学 客座生
+1/2
2楼2011-02-09 11:19:19
3楼2011-09-05 19:53:28
