应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】请问一个属下的不同的种16SrDNA序列是否一定有很大一部分序列是一致的？
131/1返回列表
查看: 1924  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ashen1944

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】请问一个属下的不同的种16SrDNA序列是否一定有很大一部分序列是一致的？

请问一个属下的不同的种16SrDNA序列是否一定有很大一部分序列是一致的？那如何能够找到这相同部分的碱基序列那？

[ Last edited by ashen1944 on 2011-1-14 at 10:55 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-01-14 10:54:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)
★ ★
ashen1944(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+1): 谢谢参与 2011-02-12 12:11:23
下载一些模式种的16SrDNA序列做multiple alignment
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2011-01-14 11:19:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fykxy_206

木虫 (正式写手)
★ ★
ashen1944(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+1): 谢谢参与 2011-02-12 12:11:34
在NCBI中的GeneBank中将同一种属的不同16srdna下载下来，用分析比对软件比对就可以啦。
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2011-01-14 12:00:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yusuya

木虫 (小有名气)

何止是一大部分相同啊

★ ★
ashen1944(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+1): 谢谢参与，能举例子就更好了 2011-02-12 12:12:01
有很多属于同一个属不同种的16s是完全相同呢，楼主的问题也是我想请教大家的。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2011-01-14 21:05:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zxx123

金虫 (正式写手)
★
ashen1944(金币+1):谢谢参与
一般90%以上相同
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2011-02-11 23:47:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangy0908

金虫 (正式写手)
★
ashen1944(金币+1):谢谢参与
最好去NCBI下载相同术夫人不同物种来比较的！有一些属的士达到80%相同。
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2011-02-12 02:03:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peizhilee

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
ashen1944(金币+1):谢谢参与
silicare(金币+2): 谢谢分享 2011-02-12 12:12:16
我曾在NCBI 上面做一些比对。首先是将16s扩增出来常规测序，用16S序列比对找到与之相似度在99%以上的菌株作为参考序列。将该菌高通量测序。然后将两个菌的全基因组序列进行比对分析，但是两个菌的近源度十分差。我很困惑，不知道是什么原因。
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2011-02-12 12:01:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangxn2010

木虫 (著名写手)
★
ashen1944(金币+1):谢谢参与
当然是，就是按这个分的属；
如果分不开可以再做个ITS序列。

[ Last edited by zhangxn2010 on 2011-2-12 at 15:52 ]
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2011-02-12 15:51:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yhlv666

至尊木虫 (职业作家)
用分析比对软件比对
赞一下 回复此楼
12楼2011-06-04 10:03:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
没有完全相同的吧？如果两个种的16S完全相同，那不就是一个种了
赞一下(1人) 回复此楼
13楼2011-06-04 11:43:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
zzf77662楼
2011-01-14 11:19   回复  
ashen1944(金币+1):谢谢参与
sihu171754楼
2011-01-14 11:52   回复  
ashen1944(金币+1):谢谢参与
KZ142511楼
2011-02-13 17:55   回复  
ashen1944(金币+1):谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 ashen1944 的主题更新
131/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭