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【求助/交流】重叠PCR问题
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shourjruo
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【求助/交流】重叠PCR问题
将500bp的片段与4000bp的片段进行连接的重叠PCR实验。中间引物设计没有问题,单独两片段PCR没有问题,并使用高保真不加A的taq酶,然后将两片段混合后在不加引物的情况下(其他按正常PCR体系添加)进行10轮PCR(40度退火),取这次PCR样品为模板进行正常PCR扩增,但总是得不到目的片段。
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当思考成为习惯,成功将不期而至。
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2011-01-13 09:34:21
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shourjruo
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引用回帖:
Originally posted by
gongeleven
at 2011-01-15 01:54:56:
注意两片段最好胶回收,而且比例1:1
难道overlap区正反向不对……
片段是回收的,重叠区应该没问题。
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当思考成为习惯,成功将不期而至。
9楼
2011-01-15 13:42:12
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最爱花诗雨(金币+2):鼓励交流 2011-01-13 15:50:34
shourjruo(金币+1): 2011-01-14 19:38:35
不知道你得配对区总共有多长,至少要保证20bp吧,是不是你得配不上啊。。。
感觉你不加引物的那次pcr是多余的,直接两个片段和上下游引物pcr就没问题
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几年前踏上火车那一刻都还没有意识到,从此故乡只有冬夏,再无春秋
2楼
2011-01-13 15:48:49
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rainwander(金币+2):鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-13 17:36:30
shourjruo(金币+1): 2011-01-14 19:39:00
不用等10轮后再加引物了,直接加入全长的上下游引物,一下扩三十个循环。或者大量扩增两个片段,回收后直接混合,加入pcr反应体系后扩20个循环。
不管哪种建议反应结束后再使用可以加A的聚合酶处理,使外端加入A,链接T载体,使用菌落pcr大量筛选克隆。
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2011-01-13 16:27:33
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谢谢!重叠区域有40bp
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