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【求助】DLPOLY计算出来的结果,是否要编程才能分析?
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zyj8119
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【求助】DLPOLY计算出来的结果,是否要编程才能分析?
计算出来的HISTORY文件,要怎么才能得到RDF,MSD等信息?
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2011-01-12 15:57:55
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zyj8119
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Originally posted by
winterz
at 2011-01-12 20:49:34:
在源码包中的utility目录里有很多与DLPOLY相关的工具程序,其中msprg.f、msdblk.f、msdblk2.f都是计算MSD的程序,但是DLPOLY的手册中对这些工具的介绍很粗略,一般都需要读懂它们输入部分的源代码才能知道怎么 ...
貌似这些也是需要编译的,使用ifort编译,然后把得到的那个编译好的文件,放到history文件夹里面。运行那个可执行文件?
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10楼
2011-01-12 22:16:30
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zyj8119(金币+10):应该怎么做呢? 2011-01-12 19:56:11
ghcacj(金币+1):谢谢 2011-01-13 11:43:50
vmd 自身带的分析功能可以实现
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2011-01-12 16:47:18
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zyj8119(金币+18):谢谢兄弟。。 2011-01-12 19:36:41
ghcacj(金币+3):谢谢 2011-01-13 11:43:57
引用回帖:
Originally posted by
zyj8119
at 2011-01-12 15:57:55:
计算出来的HISTORY文件,要怎么才能得到RDF,MSD等信息?
MSD使用自带的Java GUI和msdprg.f都可以计算。
RDF只要在CONTROL文件中写入以下两行,就会生成一个RDFDAT文件,里面是各原子RDF信息。
rdf 100
print rdf
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3楼
2011-01-12 19:27:24
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Originally posted by
043114076
at 2011-01-12 16:47:18:
vmd 自身带的分析功能可以实现
VMD应该怎么做?RDF和MSD都能分析吗?
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2011-01-12 19:37:32
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