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043114076木虫 (正式写手)
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【讨论】cif 晶体文件格式转化 已有3人参与
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想编一个fortran程序批量的将cif文件转化为xyz文件或者pdb文件，遇到的问题是空间向量的读取无法识别。 以下是cif文件中空间操作向量的定义： loop_ _symmetry_equiv_pos_site_id _symmetry_equiv_pos_as_xyz 1 x,y,z 2 -x,-y,1/2+z 3 1/2-x,1/2+y,1/2+z 4 1/2+x,1/2-y,z 如何将空间向量读取为表达式，生成所有的等价坐标？ 我目前想到的方法是使用shell脚本而无法用fotran来实现，但是缺点是移植性不好，输出控制也不好。 不知大家有什么办法能实现字符串与表达式之间的转换。 |
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winterz
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LZ可以试一下OpenBabel http://openbabel.org/wiki/Main_Page |
4楼2011-01-05 18:17:20
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