| 查看: 2195 | 回复: 3 | |||
043114076木虫 (正式写手)
|
[交流]
【讨论】cif 晶体文件格式转化 已有3人参与
|
|
想编一个fortran程序批量的将cif文件转化为xyz文件或者pdb文件，遇到的问题是空间向量的读取无法识别。 以下是cif文件中空间操作向量的定义： loop_ _symmetry_equiv_pos_site_id _symmetry_equiv_pos_as_xyz 1 x,y,z 2 -x,-y,1/2+z 3 1/2-x,1/2+y,1/2+z 4 1/2+x,1/2-y,z 如何将空间向量读取为表达式，生成所有的等价坐标？ 我目前想到的方法是使用shell脚本而无法用fotran来实现，但是缺点是移植性不好，输出控制也不好。 不知大家有什么办法能实现字符串与表达式之间的转换。 |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有8人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有8人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有9人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有8人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有7人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有8人回复
-
一个有机合成实验室都需要哪些设备？
已经有9人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- CIF文件在哪里产生，有几种格式？XRD卡能不能转化成CIF格式？
已经有5人回复
- 从cif文件直接导入的晶体可以用于直接计算么
已经有4人回复
- 求助从cif文件转变成pcr文件（用于fullprof拟合）
已经有9人回复
- 如何把res文件转化为cif文件？
已经有7人回复
- Ca2SiO4(JCPDS NO. 23-1042)的CIF文件求助
已经有4人回复
- 【求助】ACTA.E投稿FCF文件怎么转化为CIF格式啊？急！！！！
已经有4人回复
- 【求助】求将vasp的输出文件转化成xyz坐标的脚本
已经有11人回复
- 【求助】cif文件的填写问题
已经有11人回复
- 根据晶体CIF资料转换Simulated XRD
已经有1人回复
- 请教 如何转化CIF
已经有22人回复
ghcacj
荣誉版主 (著名写手)
阿超
- 模拟EPI: 16
- 应助: 26 (小学生)
- 贵宾: 2.764
- 金币: 2543.5
- 散金: 8899
- 红花: 35
- 沙发: 3
- 帖子: 1376
- 在线: 1199小时
- 虫号: 513281
- 注册: 2008-02-27
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 分子模拟
2楼2011-01-04 17:09:43
043114076
木虫 (正式写手)
- 应助: 49 (小学生)
- 金币: 3364.9
- 散金: 52
- 红花: 23
- 帖子: 788
- 在线: 369.5小时
- 虫号: 570592
- 注册: 2008-06-07
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2011-01-04 20:17:28
winterz
木虫 (小有名气)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3774.3
- 红花: 1
- 帖子: 81
- 在线: 918.1小时
- 虫号: 935931
- 注册: 2010-01-01
- 专业: 理论和计算化学
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2011-01-06 09:17:10
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2011-01-06 09:17:10
|
LZ可以试一下OpenBabel http://openbabel.org/wiki/Main_Page |
4楼2011-01-05 18:17:20
50