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【求助】用gaussian view打开优化好的结构后,将断裂键连上,是否影响后面计算 已有9人参与
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| 我在计算单糖键能时,需分两步,第一步是优化,第二步是能量计算.在优化好以后,我用gaussian view打开优化好的结构,常常发现有些单键断了,而有些双键变成了单键.此时我能否用手动的方法将断开的单键连上,也将变化为双键的单键再变回双键.这样手动修改,制作出来的输入文件是否会在后面的能量计算中发生错误? |
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erylingjet(金币+5):感谢交流！ 2010-12-29 22:40:27
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| 不用在意Gaussview中的键型，你只要没有调整键长键角之类的数据，对计算没有任何影响。Gaussian是不会自动计算键级的，Gaussview中的键型完全是根据两个原子之间的长度确定的。比如程序默认的A和B两个原子距离为2时为双键，1.5时为单键，那么如果计算结果中A和B之间的距离为2.001，就显示成双键，1.999就显示单键，1.501也是单键，而1.499就显示键断开了。实际上Gaussian程序读取的仅仅是原子的坐标，改变键型是不改变各个原子的位置的，自然也不会对计算结果产生影响。 |
7楼2010-12-29 21:00:28
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