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Hansongtao

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[交流] 【求助】用gaussian view打开优化好的结构后,将断裂键连上,是否影响后面计算 已有9人参与

我在计算单糖键能时,需分两步,第一步是优化,第二步是能量计算.在优化好以后,我用gaussian view打开优化好的结构,常常发现有些单键断了,而有些双键变成了单键.此时我能否用手动的方法将断开的单键连上,也将变化为双键的单键再变回双键.这样手动修改,制作出来的输入文件是否会在后面的能量计算中发生错误?
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狼外婆

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
erylingjet(金币+2):感谢交流! 2010-12-29 22:40:38
一般没有影响。但不排除键长的变化造成与其它原子距离的改变而影响GC对初始结构的判断。所以最好根据数据来判断而不是根据显示的结果。
8楼2010-12-29 21:38:43
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