24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

feiye2214

木虫 (正式写手)

MolEPI: 1
应助: 3 (幼儿园)
金币: 1824.9
帖子: 564
在线: 209小时
虫号: 883642

[交流] 【求助/交流】小弟对启动子序列的确定有惑，望解惑。

是不是有软件能预测分析启动子序列？

我现在已经P出来了一段800bp的基因序列了，BLAST之后同源性还是很好的（94%），我最紧迫的任务是克隆这个基因的启动子片段（cDNA不是首要任务），有Genome Walking Kit，染色体步移几次，应该能搞到上游10kb吧，就可以把启动子区域囊括进去了，问题来了，怎么确定从哪到哪是启动子序列？

听说有软件能预测分析启动子序列？真的有么？准确性如何？

[ Last edited by feiye2214 on 2010-12-26 at 22:51 ]

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子生化实验经验积累

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

粉末颗粒粒度低于-325目的粒度测试方法有哪些？用什么设备？希望大家帮帮你忙已经有6人回复
WPS2012专业增强版+序列号含VBA数据透视表图表模板等已经有129人回复
过水断面面积水环境流量最小生态环境流量确定问题求解惑急！已经有8人回复
重大问题，有谁知道pMD18-t等Amp+抗性载体中AmpR的启动子序列是什么？已经有3人回复
如何确定启动子已经有16人回复
求大肠杆菌 lpp（脂蛋白）启动子的序列~ 谢谢~~~~~在线等已经有3人回复
【求助/交流】关于分离启动子序列已经有8人回复
【求助/交流】怎么查找已知名字的启动子序列？已经有6人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2010-12-26 20:36:24

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

magy2006

木虫 (著名写手)

应助: 4 (幼儿园)
金币: 2597
帖子: 1333
在线: 130.6小时
虫号: 284913

feiye2214(金币+20): 2010-12-28 09:34:24

据我有限的知识，启动子区域的研究不是以碱基为单位的，而是以“区段”为单位的，哪些区段起核心作用，哪些起一般作用，哪些可有可无是一般研究的问题所在。所以没必要追究“从几号碱基到几号碱基是启动子范围“，你先把5K左右的区段获得，然后通过软件分析，把不同的区段构建载体，看看其启动表达能力就可以了……

赞一下

回复此楼

14楼2010-12-28 09:14:46

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 18 个回答

feiye2214

木虫 (正式写手)

MolEPI: 1
应助: 3 (幼儿园)
金币: 1824.9
帖子: 564
在线: 209小时
虫号: 883642

引用回帖:

Originally posted by feiye2214 at 2010-12-26 20:36:24:
是不是有软件能预测分析启动子序列？

我现在已经P出来了一段800bp的基因序列了，BLAST之后同源性还是很好的（94%），我最紧迫的任务是克隆这个基因的启动子片段（cDNA不是首要任务），有Genome Walking Kit，染 ...

给自己顶下啦