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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS中dmol3模块——两种分子的共吸附优化
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紫石婴宁

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】MS中dmol3模块——两种分子的共吸附优化 已有5人参与

有谁做过两种分子同时吸附在金属表面的优化？不知道两种分子放在一起同时优化和先放一种分子优化再放另一种有什么区别？
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春暖花开，春意盎然，春心荡漾....
1楼 2010-12-13 10:10:27
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紫石婴宁

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wydzyx2003 at 2010-12-13 12:40:38:
没做过，不过你可以自己算一下，试试啊。

主要是现在时间不够，所以我想问一下，看有谁做过没有，可以指导一下，这样会省很多时间
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春暖花开，春意盎然，春心荡漾....
3楼2010-12-14 15:47:51
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wydzyx2003

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢回复 2010-12-13 14:45:57
没做过，不过你可以自己算一下，试试啊。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-12-13 12:40:38
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wangyoucheng

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵
请问你的问题解决了没有，我也遇到同样的问题，我在用dmol3进行过渡态搜索的时候反应物是两种物质，是把这两种物质放在一个3D文件里优化还是分别优化呢，这个问题困扰了很长时间，身边没有朋友用这软件，还请赐教哈！
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4楼2012-04-09 14:27:04
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紫石婴宁

木虫 (小有名气)
引用回帖:
1961298楼: Originally posted by wangyoucheng at 2012-04-09 14:27:04:
请问你的问题解决了没有，我也遇到同样的问题，我在用dmol3进行过渡态搜索的时候反应物是两种物质，是把这两种物质放在一个3D文件里优化还是分别优化呢，这个问题困扰了很长时间，身边没有朋友用这软件，还请赐教 ...

我做两种物质在金属表面的共同吸附的时候，是先优化一种吸附物，后加入另一种吸附物质的。这样做具体和一起优化有没有差别我现在还不太清楚。
至于你的问题，我觉得是应该把两种物质放在一个3D文件中进行优化，这样在构造产物的时候也是在一个3D文件中，并且只有这样才能进行过渡态搜索的计算吧。要注意的就是优化前两个反应物之间的距离，保持适当的距离才能使二者之间没有作用力或者有作用力，这要根据你是否想让两者之间产生作用来调整了
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春暖花开，春意盎然，春心荡漾....
5楼2012-04-09 15:24:27
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