查看: 1977  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liming_gz

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】刚测序回来的序列,请帮忙分析一下! 已有5人参与

本人门外汉,通过测序获得片段如下:
TCTTCCAAGGCTGCGATCCCTCCACTGGCTTCCGGTAGCTGCACGCATCAGATTCAAAACACTGATGCTGGCCTACAAAGCCAAAAATGGACCAGCTCCCTCTTACCTCAAAGCCCTCATCACTCCTCGCACTGCACCCCGCACCCTCCGATCTACCAGCACTGCTCGACTGGTTCCACCATCTCTCAGGGTAAGAGGCAAGTATACTACAAGACTCTTCTCTGTACTGGCACCAAGGTGGTGGAACGAACTTCCCCTAGAGGTCCGGACAGCTGAGTCACTGGCTATTTTCAAGCGGCGGTTGAAGACCTACTTATTCAGGAAACACTTCAACTAGCACTTCTTTCATTATCTTTTGCATTTAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACACCTTTGACACTTTCATTGTAACTTTGAACAAATGTTTTAAACTCATGGTATCTTAAGTATGTAACTTAGTGATCCAGCATTAATGTATTCAATGTTAGAGATTTAAGCACTTATGTACGTCGCTCTGGATAAGGGCGTCTGCCAAATGCTGTAAATGTAAATGTAAATGTAAATGTACTACTGTAAGTCAGGCTAAAAGTAAATAGC
ACCATATTGAATTCGGAGCGGCGTTCAACC

设计的目的是获得TNF片段,比对后什么也没有获得,请高手帮忙分析一下,这段片段还有什么意义没有

背景是这样的:我想获得一条鱼的TNF片段,因为没有报道过,就拿别的鱼的TNF片段进行兼并引物设计,在目的片段长度获得清晰的条带,于是拿去测序。但在设计引物的时候我有一点不太明白,兼并引物设计每次比对的时候用几条序列,在选择序列的时候,是应该都选择近源物种还是在加一条远一点的进行比对!

很多东西都不懂,恳请帮助!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liming_gz

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by xp198766 at 2010-12-12 16:24:04:
Ictalurus furcatus?
gb|HP433966.1|  TSA: Ictalurus furcatus Contig04565.Icfu mRNA sequence

我也进行了好几次比对,但现在又一点不太明白的是,序列出现了好多A,我现在不敢肯定是测序的问题,还是序列本身就有这个问题!
4楼2010-12-13 19:29:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

NCBI blast 一下!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
2楼2010-12-12 11:22:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
dhd997(金币+1):鼓励交流 2010-12-12 18:05:50
Ictalurus furcatus?
gb|HP433966.1|  TSA: Ictalurus furcatus Contig04565.Icfu mRNA sequence
3楼2010-12-12 16:24:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
多测几次,还有就是一次测序只能得到有效片断长度为700bp,你可能是双向,或测通
5楼2010-12-13 21:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么? +3 好运来~9527 2026-10-10 6/300 2026-10-12 14:55 by 简单化xn
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了,离AI做有机合成还有多远? +4 wangyl_123 2026-10-10 7/350 2026-10-12 14:47 by chuans0923
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:26 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 22:11 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷!
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬,路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费,对账才发现官费比别人多掏了一倍 +5 13108017953 2026-10-08 5/250 2026-10-10 11:15 by wdwd123
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些? +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
请填处理意见