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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】刚测序回来的序列，请帮忙分析一下！
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liming_gz

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】刚测序回来的序列，请帮忙分析一下！ 已有5人参与

本人门外汉，通过测序获得片段如下：
TCTTCCAAGGCTGCGATCCCTCCACTGGCTTCCGGTAGCTGCACGCATCAGATTCAAAACACTGATGCTGGCCTACAAAGCCAAAAATGGACCAGCTCCCTCTTACCTCAAAGCCCTCATCACTCCTCGCACTGCACCCCGCACCCTCCGATCTACCAGCACTGCTCGACTGGTTCCACCATCTCTCAGGGTAAGAGGCAAGTATACTACAAGACTCTTCTCTGTACTGGCACCAAGGTGGTGGAACGAACTTCCCCTAGAGGTCCGGACAGCTGAGTCACTGGCTATTTTCAAGCGGCGGTTGAAGACCTACTTATTCAGGAAACACTTCAACTAGCACTTCTTTCATTATCTTTTGCATTTAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACACCTTTGACACTTTCATTGTAACTTTGAACAAATGTTTTAAACTCATGGTATCTTAAGTATGTAACTTAGTGATCCAGCATTAATGTATTCAATGTTAGAGATTTAAGCACTTATGTACGTCGCTCTGGATAAGGGCGTCTGCCAAATGCTGTAAATGTAAATGTAAATGTAAATGTACTACTGTAAGTCAGGCTAAAAGTAAATAGC
ACCATATTGAATTCGGAGCGGCGTTCAACC

设计的目的是获得TNF片段，比对后什么也没有获得，请高手帮忙分析一下，这段片段还有什么意义没有

背景是这样的：我想获得一条鱼的TNF片段，因为没有报道过，就拿别的鱼的TNF片段进行兼并引物设计，在目的片段长度获得清晰的条带，于是拿去测序。但在设计引物的时候我有一点不太明白，兼并引物设计每次比对的时候用几条序列，在选择序列的时候，是应该都选择近源物种还是在加一条远一点的进行比对！

很多东西都不懂，恳请帮助！
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1楼 2010-12-12 10:49:15
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
测序结果预处理。去掉峰值低的部分和杂峰。
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8楼2010-12-14 10:42:27
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