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汕头大学海洋科学接受调剂
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nufang19a

金虫 (正式写手)


[交流] 【讨论】生成立方水体前后中心位置有变化,什么原因??谢谢 已有2人参与

在生成立方水体前后发现体系的中心位置有变化,是不是加水后在蛋白质内部有的地方水加的不合理啊??
package require solvate  
solvate 1kimz.psf 1kimz.pdb -t 8 -o 1kimz_wb


生成立方体前如图:

生成立方水体后:
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nufang19a

金虫 (正式写手)


高手们,期待你们的回复啊
3楼2010-12-10 12:39:50
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nufang19a

金虫 (正式写手)


自己顶,期待回答
2楼2010-12-10 12:01:46
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tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

自己顶吧,我也顶
5楼2010-12-10 16:21:35
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nufang19a

金虫 (正式写手)


★ ★
zh1987hs(金币+2):鼓励 2010-12-10 22:49:18
自己顶后,自己回答:
贴子中的差别不大且是正常的,因为加水前是蛋白的,加水后是水盒子的,所以有差别。另外,我这个蛋白是二聚体,一开始我以为是因为加水后,有的空腔不该加水的水加进去了,一开始一位是这个原因造成的,后来经别人提醒才想到,水是游离的,即使加水时在某个空腔不加水,加水后水分子也会游离进去的,除非在特别的位置加结晶水。这又是一个问题啊,自己根本没想到过还有加结晶水这一回事。学要努力学习啊
6楼2010-12-10 19:07:49
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