| 查看: 873 | 回复: 2 | |||
[交流]
【求助】Gaussian core model 的LAMMPS模拟
|
|
大家好 我用LAMMPS模拟Gaussian core model ，发现模拟后粒子都集中在一个非常小的区域，都重叠在一起了。不知道是为什么。请各位指点一下 下面是我的LAMMPS模拟的in 文件 #GCM AT 0.04 units lj boundary p p p atom_style atomic lattice fcc 3.419952 region box block 0 8.0 0 8.0 0 8.0 create_box 1 box create_atoms 1 box pair_style gauss 3.2 pair_coeff * * 1.0 0.9 mass 1 1.0 timestep 0.05 thermo 100 neighbor 0.5 bin neigh_modify every 4 delay 0 check yes velocity all create 0.04 4928459 rot yes dist gaussian fix 1 all nvt temp 0.04 0.04 1.5 drag 0.3 thermo_style custom step temp press vol etotal log log_1.gcm run 500000 dump 1 all custom 100 dump_1.gcm id x y z #fix 3 all msd 100 msd_1.gcm run 10000 unfix 1 clear next x jump in.eam |
回复此楼» 猜你喜欢
我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？
已经有3人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有18人回复
-
国自然评审意见
已经有15人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有13人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有14人回复
-
系统查不到
已经有11人回复
-
有没有仍没收到信息的
已经有3人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有8人回复
-
基金不中，共勉
已经有11人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有9人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何在lammps里加入新的势函数形式？
已经有6人回复
- 各位高手，怎么在windows下编译LAMMPS？
已经有4人回复
- lammps的时间步长问题
已经有16人回复
- 薄膜在lammps条件下的谐振
已经有5人回复
- LAMMPS Error:lost atoms
已经有7人回复
- 寻求lammps的应用 欢迎大家畅所欲言
已经有8人回复
- 【求助】LAMMPS、NAMD和CHARMM谁最适合生物大分子模拟？
已经有8人回复
- 【求助】Lammps 多机并行的问题
已经有11人回复
2楼2010-11-26 12:54:25
★ ★ ★ ★
cxz314(金币+5):非常感谢！我在核实一下 2010-11-27 19:57:37
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-11-29 18:23:05
cxz314(金币+5):非常感谢！我在核实一下 2010-11-27 19:57:37
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-11-29 18:23:05
|
cxz314(金币+1):谢谢！是这样的Gaussian core model 的约化单位和LJ势的约化单位一样的 这个。。。我有点不明白，pair_style gauss的势函数形式是 E=Aexp(-Br^2) ，这样的势，要用约化单位么？那你的sigma，epsilon之类是如何设置的？都是1么？那你的 lattice fcc 3.419952，还有region, 都是约化单位么？建议你再核实一下。不过我不是很了解这个势，也可能没有问题。 |
3楼2010-11-27 17:39:21
投票:
10