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cxz314

木虫 (正式写手)


[交流] 【求助】Gaussian core model 的LAMMPS模拟

大家好
我用LAMMPS模拟Gaussian core model ,发现模拟后粒子都集中在一个非常小的区域,都重叠在一起了。不知道是为什么。请各位指点一下
下面是我的LAMMPS模拟的in 文件
#GCM AT 0.04
units  lj
boundary  p p p
atom_style  atomic

lattice   fcc   3.419952
region   box block 0 8.0 0 8.0 0 8.0
create_box  1 box
create_atoms  1 box

pair_style  gauss  3.2
pair_coeff  * * 1.0 0.9
mass        1 1.0

timestep  0.05
thermo  100

neighbor  0.5 bin
neigh_modify  every 4 delay 0 check yes

velocity  all create 0.04 4928459 rot yes dist gaussian
fix        1 all nvt temp 0.04 0.04 1.5 drag 0.3
thermo_style custom step temp press vol etotal
log        log_1.gcm
run      500000

dump  1 all custom 100 dump_1.gcm id x y z
#fix      3 all msd 100 msd_1.gcm
run      10000
unfix       1
clear
next     x
jump     in.eam
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★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-11-26 12:55:03
cxz314(金币+1):谢谢!是这样的Gaussian core model 的约化单位和LJ势的约化单位一样的 2010-11-26 13:07:46
你的势函数是Gauss势,但你的单位用的是LJ? 你先核实一下是不是这样。
2楼2010-11-26 12:54:25
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★ ★ ★ ★
cxz314(金币+5):非常感谢!我在核实一下 2010-11-27 19:57:37
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-11-29 18:23:05
cxz314(金币+1):谢谢!是这样的Gaussian core model 的约化单位和LJ势的约化单位一样的


这个。。。我有点不明白,pair_style gauss的势函数形式是 E=Aexp(-Br^2) ,这样的势,要用约化单位么?那你的sigma,epsilon之类是如何设置的?都是1么?那你的 lattice fcc  3.419952,还有region, 都是约化单位么?建议你再核实一下。不过我不是很了解这个势,也可能没有问题。
3楼2010-11-27 17:39:21
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