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【求助】Gaussian core model 的LAMMPS模拟
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大家好 我用LAMMPS模拟Gaussian core model ，发现模拟后粒子都集中在一个非常小的区域，都重叠在一起了。不知道是为什么。请各位指点一下 下面是我的LAMMPS模拟的in 文件 #GCM AT 0.04 units lj boundary p p p atom_style atomic lattice fcc 3.419952 region box block 0 8.0 0 8.0 0 8.0 create_box 1 box create_atoms 1 box pair_style gauss 3.2 pair_coeff * * 1.0 0.9 mass 1 1.0 timestep 0.05 thermo 100 neighbor 0.5 bin neigh_modify every 4 delay 0 check yes velocity all create 0.04 4928459 rot yes dist gaussian fix 1 all nvt temp 0.04 0.04 1.5 drag 0.3 thermo_style custom step temp press vol etotal log log_1.gcm run 500000 dump 1 all custom 100 dump_1.gcm id x y z #fix 3 all msd 100 msd_1.gcm run 10000 unfix 1 clear next x jump in.eam |
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2楼2010-11-26 12:54:25
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cxz314(金币+5):非常感谢！我在核实一下 2010-11-27 19:57:37
ghcacj(金币+4):谢谢 2010-11-29 18:23:05
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ghcacj(金币+4):谢谢 2010-11-29 18:23:05
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cxz314(金币+1):谢谢！是这样的Gaussian core model 的约化单位和LJ势的约化单位一样的 这个。。。我有点不明白，pair_style gauss的势函数形式是 E=Aexp(-Br^2) ，这样的势，要用约化单位么？那你的sigma，epsilon之类是如何设置的？都是1么？那你的 lattice fcc 3.419952，还有region, 都是约化单位么？建议你再核实一下。不过我不是很了解这个势，也可能没有问题。 |
3楼2010-11-27 17:39:21
