| 查看: 4597 | 回复: 13 | |||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||
[交流]
【求助】MS中建立amorphous cell时如何修改其周期边界条件
|
|||||
|
各位大侠，我创建了包含4个单体的homopolymer型的聚乙烯链，然后想在Amorphous Cell Tools模块里建立amorphous cell，下图是创建amorphous cell的窗口和构建后的包含10条PE链的晶胞。构建晶胞时，系统默认的是XYZ三个方向上都建立了周期边界边界条件（如标记处所示）。 问一下各位，如何进行设置，使XY方向上建立周期边界条件，而在Z方向上自由？ 谢谢各位了！   |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 materials studio系列 | 分子模拟 |
» 猜你喜欢
材料工程085601，270求调剂
已经有24人回复
-
085404 293求调剂
已经有3人回复
-
调剂
已经有21人回复
-
复试调剂，一志愿郑州大学材料与化工289分
已经有15人回复
-
08工科求调剂290分
已经有12人回复
-
286求调剂
已经有16人回复
-
材料类284调剂
已经有24人回复
-
考研调剂-材料类-284
已经有14人回复
-
327求调剂
已经有11人回复
-
一志愿985初试354分生物调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎样根据下列条件在NCBI上搜索到基因序列的全长
已经有4人回复
- 请问能用MS软件进行热膨胀系数、自由焓、熵等热力学参数的计算吗？
已经有20人回复
- 《癌细胞》[Cancer Cell ] 十周年特刊
已经有129人回复
- 编辑大修给两月修改，我是越快越好呢，还是拖到两月？
已经有36人回复
- 【求助】求教DPD高手怎样用amorphous cell计算Flory huggins参数
已经有8人回复
- 【求助】MS的Amorphous cell使用出问题
已经有16人回复
- 【求助】有关Amorphous Cell Construction模块中对聚合物construction过程出现的一点�
已经有10人回复
- 【求助成功】MS Amorphous Cell 建模问题
已经有14人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
★★热帖★★0860生物与医药调剂考生看过来，河北大学化学与材料科学学院
+2/190
-
天津理工大学生命健康智能检测研究院招收2026年硕士调剂生
+1/88
-
西安石油大学新能源学院接收材料类、能源动力类、机械类、计算机类等专业专硕调剂生！
+1/88
-
宁波大学2026年紧急补招植保方向（昆虫或植病）博士研究生1-2名
+1/85
-
汕头大研究生调剂招生
+1/31
-
杭州医学院张逢质教授课题组招收药学硕士研究生若干
+1/19
-
抗病毒性传染病创新药物全国重点实验室—接收化学、生物、药学、生物与医药调剂考生
+1/17
-
汕头大学与化学与精细化工广东省实验室联合培养研究生
+5/15
-
中国石油大学（北京）理学院2026年硕士研究生接收调剂生：物理、化学、材料等
+1/11
-
★上海★上海工程技术大学·环境与资源创新中心（ICER）接收化工材料环境等学科调剂生
+1/11
-
北京化工大学材料学院高分子微针实验室招收调剂
+1/9
-
齐齐哈尔大学李莉课题组诚招2026级考研调剂生（学硕和专硕）
+1/7
-
招调剂_北京农学院_植物保护系_昆虫方向_专硕_学硕各1名
+1/6
-
欢迎调剂攀枝花学院化学工程专业，资源与环境专业，线上复试
+1/5
-
【2026考研调剂】浙江万里学院国家级青年人才团队-锂电/电催化方向招收调剂生
+1/5
-
台州学院接收化学、化工与材料方向调剂
+1/3
-
福建理工大学材料学院招收专业代码08开头学术型硕士研究生
+1/3
-
武汉大学国家特聘青年教授侯绍聪课题组招收多名物理/化学/材料/电子/电气等专业博生生
+1/2
-
济南大学2026年硕士研究生招生预调剂公告
+1/1
-
招调剂生: 植物学（学硕），资源利用与植物保护（专硕）
+1/1
6楼2011-04-18 19:35:22
3楼2010-11-25 23:42:26
7楼2011-04-18 20:55:55
|
MS中建立表面的过程大致就是: 先导入体材结构,之后build->surfaces->cleave surface,在cleave surface对话框中可以具体的设置表面参数. 首先是surface box,这页中的参数比较容易填写. cleave plane选项是你要切割的表面,你要选择哪个表面肯定是确定的,因此没有什么说的 TOP是体材中平面所在的位置,某一方向的面,在体材中可能截取在不同的位置上. Depth是截取的slab的厚度,建议多取一些,建立模型之后觉得取多了可以删除,如果取少了还得返工. 觉得建立表面,尤其是界面,关键的问题多是在Surface mash分页选项中 我们知道,对于同一个晶体结构,如果选择晶格矢量的不同,那么得到的晶胞形状是差很多的.对于表面,Surface vectors(也就是前面提到的u,v)就是它的晶格矢量.如果单纯考虑一个表面的话,选择什么基失都没有关系,选择最小的重复单元就可以了.但是如果建立界面则需要考虑匹配的问题,选择的结构单元不对则两个表面匹配不上.比如有时看到类似(根号3)*(根号3)这样的表面(不会输入"根号",丢人了),这是表示使用的基失是最小基失的(根号3)倍长.但郁闷的是文献中提供的信息一般只到这里,具体这个长度对应哪个方向还要自己找. 具体设置的时候,u,v就是两个基失方向,注意的是u,v一定要在所选平面内,并且两个矢量不平行,否则会出错. Mesh origin晶格矢量原点所在位置,这个不是很重要 至此,表面的切割就基本完成了,点cleave完成 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
数峰青8208楼2011-04-18 22:19:31
