| 查看: 4470 | 回复: 13 | |||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||
[交流]
【求助】MS中建立amorphous cell时如何修改其周期边界条件
|
|||||
|
各位大侠，我创建了包含4个单体的homopolymer型的聚乙烯链，然后想在Amorphous Cell Tools模块里建立amorphous cell，下图是创建amorphous cell的窗口和构建后的包含10条PE链的晶胞。构建晶胞时，系统默认的是XYZ三个方向上都建立了周期边界边界条件（如标记处所示）。 问一下各位，如何进行设置，使XY方向上建立周期边界条件，而在Z方向上自由？ 谢谢各位了！   |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 materials studio系列 | 分子模拟 |
» 猜你喜欢
268求调剂
已经有8人回复
-
26申博
已经有4人回复
-
211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习
已经有7人回复
-
求调剂，总分315，考的生物医药，一志愿湖南师范大学。调剂到任何专业都可以
已经有3人回复
-
材料专硕306英一数二
已经有7人回复
-
材料工程专硕274一志愿211求调剂
已经有6人回复
-
一志愿南京大学，080500材料科学与工程，调剂
已经有4人回复
-
332求调剂
已经有5人回复
-
271求调剂
已经有14人回复
-
275求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎样根据下列条件在NCBI上搜索到基因序列的全长
已经有4人回复
- 请问能用MS软件进行热膨胀系数、自由焓、熵等热力学参数的计算吗？
已经有20人回复
- 《癌细胞》[Cancer Cell ] 十周年特刊
已经有129人回复
- 编辑大修给两月修改，我是越快越好呢，还是拖到两月？
已经有36人回复
- 【求助】求教DPD高手怎样用amorphous cell计算Flory huggins参数
已经有8人回复
- 【求助】MS的Amorphous cell使用出问题
已经有16人回复
- 【求助】有关Amorphous Cell Construction模块中对聚合物construction过程出现的一点�
已经有10人回复
- 【求助成功】MS Amorphous Cell 建模问题
已经有14人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
山东征女友，坐标济南
+1/168
-
物理学 调剂
+1/80
-
太原理工大学博士招生 电池负极材料 固态电解质方向 有工作经验者优先
+1/79
-
山东师范大学有机化学专业胡忠燕老师课题组招收2026届硕士研究生以及调剂生
+1/41
-
华南师范大学（211）博士招生- 电子、自动化、机械、生物学、物理相关专业
+2/38
-
2026年重庆工商大学管理科学与工程专业学术硕士招生调剂，风景总在柳暗花明处
+1/36
-
关于碳量子点抗菌的研究
+1/35
-
广东工业大学管理科学与工程专业博士招生
+1/34
-
【沈阳农业大学机械专硕调剂】
+2/30
-
纺织科学与工程、材料化工方向招收研究生
+1/28
-
欢迎交流咨询
+1/19
-
【预硕】【预博】青岛大学生物医药创新转化
+1/17
-
26年申博自荐-计算机视觉
+1/8
-
聊城大学化院青椒招收化学相关专业调剂学生
+1/7
-
重庆大学药学院闫海龙课题组拟招收2026年申请考核制博士研究生
+1/5
-
博后即将出站，求稳定的教职
+1/5
-
南方科技大学生命科学学院基础免疫与微生物学系招收博士后
+1/4
-
课题组招收环境及相关专业调剂硕士研究生（欢迎优秀学生加入）
+1/2
-
五邑大学环境与化学化工学院欢迎化学、化工、材料背景考生报考
+1/1
-
药学专硕一志愿苏大本科苏大寻求B区高校调剂名额
+1/1
6楼2011-04-18 19:35:22
3楼2010-11-25 23:42:26
7楼2011-04-18 20:55:55
|
MS中建立表面的过程大致就是: 先导入体材结构,之后build->surfaces->cleave surface,在cleave surface对话框中可以具体的设置表面参数. 首先是surface box,这页中的参数比较容易填写. cleave plane选项是你要切割的表面,你要选择哪个表面肯定是确定的,因此没有什么说的 TOP是体材中平面所在的位置,某一方向的面,在体材中可能截取在不同的位置上. Depth是截取的slab的厚度,建议多取一些,建立模型之后觉得取多了可以删除,如果取少了还得返工. 觉得建立表面,尤其是界面,关键的问题多是在Surface mash分页选项中 我们知道,对于同一个晶体结构,如果选择晶格矢量的不同,那么得到的晶胞形状是差很多的.对于表面,Surface vectors(也就是前面提到的u,v)就是它的晶格矢量.如果单纯考虑一个表面的话,选择什么基失都没有关系,选择最小的重复单元就可以了.但是如果建立界面则需要考虑匹配的问题,选择的结构单元不对则两个表面匹配不上.比如有时看到类似(根号3)*(根号3)这样的表面(不会输入"根号",丢人了),这是表示使用的基失是最小基失的(根号3)倍长.但郁闷的是文献中提供的信息一般只到这里,具体这个长度对应哪个方向还要自己找. 具体设置的时候,u,v就是两个基失方向,注意的是u,v一定要在所选平面内,并且两个矢量不平行,否则会出错. Mesh origin晶格矢量原点所在位置,这个不是很重要 至此,表面的切割就基本完成了,点cleave完成 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
数峰青8208楼2011-04-18 22:19:31
