| 查看: 4467 | 回复: 13 | |||||
[交流]
【求助】MS中建立amorphous cell时如何修改其周期边界条件
|
|||||
|
各位大侠，我创建了包含4个单体的homopolymer型的聚乙烯链，然后想在Amorphous Cell Tools模块里建立amorphous cell，下图是创建amorphous cell的窗口和构建后的包含10条PE链的晶胞。构建晶胞时，系统默认的是XYZ三个方向上都建立了周期边界边界条件（如标记处所示）。 问一下各位，如何进行设置，使XY方向上建立周期边界条件，而在Z方向上自由？ 谢谢各位了！   |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 materials studio系列 | 分子模拟 |
» 猜你喜欢
26申博
已经有3人回复
-
求调剂，总分315，考的生物医药，一志愿湖南师范大学。调剂到任何专业都可以
已经有3人回复
-
材料专硕306英一数二
已经有7人回复
-
材料工程专硕274一志愿211求调剂
已经有6人回复
-
318求调剂
已经有5人回复
-
一志愿南京大学，080500材料科学与工程，调剂
已经有4人回复
-
332求调剂
已经有5人回复
-
271求调剂
已经有14人回复
-
275求调剂
已经有4人回复
-
302求调剂
已经有8人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎样根据下列条件在NCBI上搜索到基因序列的全长
已经有4人回复
- 请问能用MS软件进行热膨胀系数、自由焓、熵等热力学参数的计算吗？
已经有20人回复
- 《癌细胞》[Cancer Cell ] 十周年特刊
已经有129人回复
- 编辑大修给两月修改，我是越快越好呢，还是拖到两月？
已经有36人回复
- 【求助】求教DPD高手怎样用amorphous cell计算Flory huggins参数
已经有8人回复
- 【求助】MS的Amorphous cell使用出问题
已经有16人回复
- 【求助】有关Amorphous Cell Construction模块中对聚合物construction过程出现的一点�
已经有10人回复
- 【求助成功】MS Amorphous Cell 建模问题
已经有14人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
青岛高校2026招生硕士研究生
+5/960
-
深圳技术大学集成电路与光电芯片学院郝俊杰课题组诚聘博士后、研究助理、访问学生
+2/128
-
【技术服务】研究所横向技术开发及服务
+1/99
-
物理学 调剂
+1/89
-
愿遇见你，遇见不止擦肩而过的缘分
+1/81
-
何时使用 CODA™ 科里奥利质量流量仪表- 艾里卡特（Alicat）
+2/52
-
催化方向推荐一个极好的博导
+1/44
-
湘潭大学“过程强化与绿色化工”创新团队补招2026年秋入学博士生
+1/36
-
招硕士调剂生
+2/26
-
新疆大学招收学硕调剂
+1/24
-
211/双一流石河子大学化学化工学院-电催化，单原子催化，CO2转化
+1/18
-
【预硕】【预博】青岛大学生物医药创新转化
+1/17
-
26年申博自荐-计算机视觉
+1/13
-
【博士招生】武汉科技大学招收材料、化工、环境、冶金类2026年“申请-考核”制博士生
+1/8
-
哈尔滨理工大学材料与化学工程学院 纳米功能材料与光电催化团队 招收硕士研究生
+1/7
-
聊城大学化院青椒招收化学相关专业调剂学生
+1/7
-
请问为什么我的贴子自动到“已删除的主题”里而没有被发布？
+1/5
-
求推荐性价比好用的球磨罐
+1/3
-
北京大学环境学院张子帅研究员招收科研助理
+1/3
-
招收理论凝聚态物理/纳米光学/量子计算方向博士、硕士研究生/博士后
+1/1
|
MS中建立表面的过程大致就是: 先导入体材结构,之后build->surfaces->cleave surface,在cleave surface对话框中可以具体的设置表面参数. 首先是surface box,这页中的参数比较容易填写. cleave plane选项是你要切割的表面,你要选择哪个表面肯定是确定的,因此没有什么说的 TOP是体材中平面所在的位置,某一方向的面,在体材中可能截取在不同的位置上. Depth是截取的slab的厚度,建议多取一些,建立模型之后觉得取多了可以删除,如果取少了还得返工. 觉得建立表面,尤其是界面,关键的问题多是在Surface mash分页选项中 我们知道,对于同一个晶体结构,如果选择晶格矢量的不同,那么得到的晶胞形状是差很多的.对于表面,Surface vectors(也就是前面提到的u,v)就是它的晶格矢量.如果单纯考虑一个表面的话,选择什么基失都没有关系,选择最小的重复单元就可以了.但是如果建立界面则需要考虑匹配的问题,选择的结构单元不对则两个表面匹配不上.比如有时看到类似(根号3)*(根号3)这样的表面(不会输入"根号",丢人了),这是表示使用的基失是最小基失的(根号3)倍长.但郁闷的是文献中提供的信息一般只到这里,具体这个长度对应哪个方向还要自己找. 具体设置的时候,u,v就是两个基失方向,注意的是u,v一定要在所选平面内,并且两个矢量不平行,否则会出错. Mesh origin晶格矢量原点所在位置,这个不是很重要 至此,表面的切割就基本完成了,点cleave完成 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
数峰青8208楼2011-04-18 22:19:31
3楼2010-11-25 23:42:26
4楼2010-11-26 00:06:48
5楼2010-11-26 00:08:35
6楼2011-04-18 19:35:22
7楼2011-04-18 20:55:55
9楼2012-12-11 09:13:34
11楼2014-09-22 17:00:06
12楼2015-05-22 11:37:59
13楼2015-05-22 12:12:02
14楼2015-06-24 09:36:49
简单回复
读书人12362楼
2010-11-25 18:43
回复
黄河之恋(金币+1):谢谢参与
御剑江湖(金币-1): 厚道 2011-04-18 20:54:08
御剑江湖(金币-1): 厚道 2011-04-18 20:54:08
su-b0810楼
2012-12-11 14:32
回复
