| 查看: 4456 | 回复: 13 | |||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||||
[交流]
【求助】MS中建立amorphous cell时如何修改其周期边界条件
|
|||||
|
各位大侠，我创建了包含4个单体的homopolymer型的聚乙烯链，然后想在Amorphous Cell Tools模块里建立amorphous cell，下图是创建amorphous cell的窗口和构建后的包含10条PE链的晶胞。构建晶胞时，系统默认的是XYZ三个方向上都建立了周期边界边界条件（如标记处所示）。 问一下各位，如何进行设置，使XY方向上建立周期边界条件，而在Z方向上自由？ 谢谢各位了！   |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 materials studio系列 | 分子模拟 |
» 猜你喜欢
化学工程321分求调剂
已经有12人回复
-
211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习
已经有4人回复
-
材料专硕326求调剂
已经有5人回复
-
东南大学364求调剂
已经有5人回复
-
国自科面上基金字体
已经有7人回复
-
药学383 求调剂
已经有4人回复
-
286求调剂
已经有5人回复
-
085601求调剂
已经有3人回复
-
302求调剂
已经有5人回复
-
考研化学学硕调剂，一志愿985
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 怎样根据下列条件在NCBI上搜索到基因序列的全长
已经有4人回复
- 请问能用MS软件进行热膨胀系数、自由焓、熵等热力学参数的计算吗？
已经有20人回复
- 《癌细胞》[Cancer Cell ] 十周年特刊
已经有129人回复
- 编辑大修给两月修改，我是越快越好呢，还是拖到两月？
已经有36人回复
- 【求助】求教DPD高手怎样用amorphous cell计算Flory huggins参数
已经有8人回复
- 【求助】MS的Amorphous cell使用出问题
已经有16人回复
- 【求助】有关Amorphous Cell Construction模块中对聚合物construction过程出现的一点�
已经有10人回复
- 【求助成功】MS Amorphous Cell 建模问题
已经有14人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
深圳技术大学集成电路与光电芯片学院郝俊杰课题组诚聘博士后、研究助理、访问学生
+2/132
-
物理学 调剂
+1/84
-
福建师范大学招收2026年化学、材料硕士3-4名
+1/82
-
太原理工大学博士招生 电池负极材料 固态电解质方向 有工作经验者优先
+1/79
-
哈工大本部-电化学新能源方向博士捡漏名额
+1/77
-
华南师范大学（211）博士招生- 电子、自动化、机械、生物学、物理相关专业
+2/46
-
湘潭大学“过程强化与绿色化工”创新团队补招2026年秋入学博士生
+1/45
-
【武汉高校】【新能源材料与器件课题组】 招收优秀硕士调剂生！！！
+5/40
-
教研论文SCI期刊投稿选刊
+1/34
-
招硕士调剂生
+2/30
-
【沈阳农业大学机械专硕调剂】
+2/30
-
2026年工科硕士调剂-上海大学全国重点实验室团队-材料数据挖掘方向-研究生3-5人
+1/30
-
招硕士调剂生
+2/28
-
厦门大学航空航天学院智能制造课题组招2026年申请审核制博士生1名
+1/22
-
【博士招生】武汉科技大学招收材料、化工、环境、冶金类2026年“申请-考核”制博士生
+1/16
-
【实战型】【生物医药】2026青岛大学招博士生 含少数民族骨干计划2名！！！
+1/11
-
聊城大学化院青椒招收化学相关专业调剂学生
+1/7
-
南方科技大学生命科学学院基础免疫与微生物学系招收博士后
+1/5
-
连发两篇 Nature！大样本单细胞测序解析认知、衰老与灵长类进化
+1/3
-
温州大学招收2026年入学博士研究生（化学、材料、环境）
+1/1
3楼2010-11-25 23:42:26
6楼2011-04-18 19:35:22
7楼2011-04-18 20:55:55
|
MS中建立表面的过程大致就是: 先导入体材结构,之后build->surfaces->cleave surface,在cleave surface对话框中可以具体的设置表面参数. 首先是surface box,这页中的参数比较容易填写. cleave plane选项是你要切割的表面,你要选择哪个表面肯定是确定的,因此没有什么说的 TOP是体材中平面所在的位置,某一方向的面,在体材中可能截取在不同的位置上. Depth是截取的slab的厚度,建议多取一些,建立模型之后觉得取多了可以删除,如果取少了还得返工. 觉得建立表面,尤其是界面,关键的问题多是在Surface mash分页选项中 我们知道,对于同一个晶体结构,如果选择晶格矢量的不同,那么得到的晶胞形状是差很多的.对于表面,Surface vectors(也就是前面提到的u,v)就是它的晶格矢量.如果单纯考虑一个表面的话,选择什么基失都没有关系,选择最小的重复单元就可以了.但是如果建立界面则需要考虑匹配的问题,选择的结构单元不对则两个表面匹配不上.比如有时看到类似(根号3)*(根号3)这样的表面(不会输入"根号",丢人了),这是表示使用的基失是最小基失的(根号3)倍长.但郁闷的是文献中提供的信息一般只到这里,具体这个长度对应哪个方向还要自己找. 具体设置的时候,u,v就是两个基失方向,注意的是u,v一定要在所选平面内,并且两个矢量不平行,否则会出错. Mesh origin晶格矢量原点所在位置,这个不是很重要 至此,表面的切割就基本完成了,点cleave完成 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
数峰青8208楼2011-04-18 22:19:31
