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zhulijuan001

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[交流] 【讨论】rdf

有没有可以详细说一下PTRAJ计算RDF的这个命令，就是这个命令的参数的具体意义以及如何设置这些参数，看了手册，可还是不太懂，我计算了一个水分子在蛋白质周围的分布，用的命令是
radial rdf 0.05 10 :WAT :1-235，可是图很异常，有没有人遇到过类似的情况，可以给一点建议？

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1楼 2010-11-24 19:40:29

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老虎大王

木虫 (著名写手)

★ ★
zhulijuan001(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-11-26 12:52:25

这个RDF没有归一化。

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5楼2010-11-25 17:53:19

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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

★
zhulijuan001(金币+1):谢谢参与

你算的明明是RMSD

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2楼2010-11-24 22:23:37

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zhulijuan001

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引用回帖:

Originally posted by lei0736 at 2010-11-24 22:23:37:
你算的明明是RMSD

是图上的标记错了，实际是RDF，横坐标是R，纵坐标是G(R)。

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3楼2010-11-25 09:29:22

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zhulijuan001

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引用回帖:

Originally posted by zhulijuan001 at 2010-11-25 09:29:22:

是图上的标记错了，实际是RDF，横坐标是R，纵坐标是G(R)。

怎么没人呀！

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4楼2010-11-25 17:00:56

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