应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【讨论】rdf
51/1返回列表
查看: 938  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhulijuan001

金虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】rdf

有没有可以详细说一下PTRAJ计算RDF的这个命令，就是这个命令的参数的具体意义以及如何设置这些参数，看了手册，可还是不太懂，我计算了一个水分子在蛋白质周围的分布，用的命令是
radial rdf 0.05 10 :WAT :1-235，可是图很异常，有没有人遇到过类似的情况，可以给一点建议？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-11-24 19:40:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhulijuan001

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by lei0736 at 2010-11-24 22:23:37:
你算的明明是RMSD

是图上的标记错了，实际是RDF，横坐标是R，纵坐标是G(R)。
赞一下 回复此楼
3楼2010-11-25 09:29:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

lei0736

荣誉版主 (职业作家)
★
zhulijuan001(金币+1):谢谢参与
你算的明明是RMSD
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-11-24 22:23:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhulijuan001

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhulijuan001 at 2010-11-25 09:29:22:

是图上的标记错了，实际是RDF，横坐标是R，纵坐标是G(R)。

怎么没人呀！
回复此楼
4楼2010-11-25 17:00:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★
zhulijuan001(金币+1):谢谢参与
ghcacj(金币+1):谢谢 2010-11-26 12:52:25
这个RDF没有归一化。
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-11-25 17:53:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭