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【求助/交流】mega软件的应用求助？ 已有4人参与
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| 我是一位mega软件的初学者，由于文章需要做系统进化树，但是mega软件的应用，我很困难。希望各位大侠帮帮忙，给提供点资料或应用帮助。谢谢啦！！！！ |
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4楼2011-01-08 15:08:55
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2楼2010-11-17 10:49:24
keqindeng
木虫 (正式写手)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 3342.8
- 散金: 884
- 红花: 2
- 帖子: 718
- 在线: 404小时
- 虫号: 1008918
- 注册: 2010-04-30
- 性别: GG
- 专业: 生化分析及生物传感
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dhd997(金币+2):good 2010-12-11 08:37:28
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dhd997(金币+2):good 2010-12-11 08:37:28
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1. 将clustal x比对好的序列转成MEGA格式 2.打开MEGA格式的文件，点PHYLOGENY，要建BOOTSTRAP检验的树，有四种建树方法，NJ， ME， MP， UPGMA。后面以NJ为例。 3。点击NJ后。点击绿色方格可以改变BOOTSTRAP中重复的次数（＞１００），GAP是pairwise 还是complete deletion （一般选ＰＡＩＲＷＩＳＥ）, 适合你数据的替换模型（有ＭＯＤＥＬＴＥＳＴ可以检验）。（一定要根据自己的数据来设这些值） 4。点击COMPUTE。结果如下，红圈中的数字就是bootstrap 值，一般大于７０％的枝认为比较有意义． 5。如果有外类群，你可以直接点击你的外类群，能得到有根树 |
3楼2010-12-11 02:30:05
rongshuxia
木虫 (著名写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 4887.1
- 散金: 27
- 红花: 2
- 帖子: 1754
- 在线: 489.6小时
- 虫号: 431387
- 注册: 2007-08-11
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
5楼2011-01-12 11:43:44
