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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】flexx做完后，分子出现杂乱，位置差异巨大
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绿茶QJM

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】flexx做完后，分子出现杂乱，位置差异巨大 已有3人参与

如何让FLEXX对接后，分子出现在一个腔内？

                      如何让分子能出现较整齐的叠合构象
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1楼 2010-11-09 15:57:28
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windness

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
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zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-11-10 08:39:28
在molecular sheet中应该可以做到这一点，不过建议LZ分析一下conformer cluster，这对于遴选你的对接结果是有帮助的。
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2楼2010-11-10 08:38:32
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houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03
★ ★
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zh1987hs(金币+1):谢谢 2010-12-19 23:03:34
用的sybyl吗？可以考虑surflexdock~
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3楼2010-12-19 18:29:38
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skee2008

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
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ghcacj(金币+2):谢谢 2010-12-20 14:53:52
可以尝试共价对接的，固定分子底物位置
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有舍有得
4楼2010-12-20 10:54:51
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《分子对接问题锦集》
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故地如重游月圆更寂寞
5楼2011-09-05 19:57:59
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