| 查看: 705 | 回复: 5 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
倚天舰木虫 (小有名气)
|
[交流]
【求助】如何计算复合物的能量 已有2人参与
|
||
小弟最近看了一篇文献，是用discover模块计算结合能的，但是很不明白如何计算两个分子形成的自组装体系的复合物的能量。希望大家教教我  图中说的中E1是SA和功能单体形成复合物的能量这个该怎么计算啊。是不是把SA和功能单体用Amorphous Cell里的construction放到一个盒子里，再用dynamic按照第一个图里所说的来模拟？谢谢大家了。 |
回复此楼» 猜你喜欢
写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？
已经有6人回复
-
带资进组求博导收留
已经有10人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有11人回复
-
需要合成515-64-0，50g，能接单的留言
已经有3人回复
-
中科院杭州医学所招收博士生一名（生物分析化学、药物递送）
已经有3人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有8人回复
-
想换工作。大多数高校都是 评职称时 认可5年内在原单位取得的成果吗？
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分层计算和公式E oniom= E high(model) +E low(real)-E low(model)之间关系的疑问
已经有4人回复
- 金属配合物稳定常数分子模拟计算
已经有7人回复
- 怎么能用量子化学计算含氮杂环芳香化合物与水分子的相互作用
已经有17人回复
- 这句话怎么个理解？这个能量怎么计算？
已经有6人回复
- 【求助】能量问题求助各位兄弟姐妹
已经有13人回复
- 【求助】CISD 计算相互作用能为什么是正值？谢谢
已经有7人回复
- 【求助】求助关于催化反应中两个反应物之间的电子转移的计算
已经有4人回复
cg陈
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 76 (初中生)
- 金币: 6627.2
- 散金: 46
- 红花: 2
- 帖子: 1253
- 在线: 445.4小时
- 虫号: 874350
- 注册: 2009-10-16
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2010-11-09 11:07:17
cg陈
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 76 (初中生)
- 金币: 6627.2
- 散金: 46
- 红花: 2
- 帖子: 1253
- 在线: 445.4小时
- 虫号: 874350
- 注册: 2009-10-16
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2010-11-08 21:36:27
倚天舰
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1487.1
- 散金: 4
- 红花: 3
- 帖子: 82
- 在线: 106小时
- 虫号: 858328
- 注册: 2009-09-27
- 专业: 生物化工与食品化工
3楼2010-11-08 21:47:02
倚天舰
木虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1487.1
- 散金: 4
- 红花: 3
- 帖子: 82
- 在线: 106小时
- 虫号: 858328
- 注册: 2009-09-27
- 专业: 生物化工与食品化工
|
Dynamics Summary ________________ Initial Final Average Std. Dev. ------- ----- ------- --------- Tot. energy (kcal/mol) 47.911 42.385 47.731 3.639 Pot. energy (kcal/mol) 9.733 5.527 9.468 3.816 Kin. energy (kcal/mol) 38.178 36.857 38.263 3.700 Temperature (K) 298.000 287.691 298.663 28.878 Pressure (GPa) 1.753138 0.107987 -0.014596 0.623124 Volume (A^3) 754.789 754.789 754.789 0.000 Density (gm/cm^3) 0.9003 0.9003 0.9003 0.0000 Time used by 5000 steps is 0 hours 0 mins 16.33 secs (0.003 secs per step) dynamic完了是这样的一个结果，是看那个Average Tot. energy吗？ |
4楼2010-11-09 09:59:42