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倚天舰

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】如何计算复合物的能量已有2人参与

小弟最近看了一篇文献,是用discover模块计算结合能的,但是很不明白如何计算两个分子形成的自组装体系的复合物的能量。希望大家教教我



图中说的中E1是SA和功能单体形成复合物的能量这个该怎么计算啊。是不是把SA和功能单体用Amorphous Cell里的construction放到一个盒子里,再用dynamic按照第一个图里所说的来模拟?谢谢大家了。
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
恩 我觉得就是这么一回事哈
2楼2010-11-08 21:36:27
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cg陈

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
sunyang1988(金币+2):感谢交流 2010-11-09 12:12:05
我不是用这个能量  是用dynamic stepup 里的energy 点calculate  

        你算之前  要把所有原子解冻 即在free下 计算能量
5楼2010-11-09 11:07:17
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