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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】结构优化时如何将原子位置固定在原胞内
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skyscorpioa

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】结构优化时如何将原子位置固定在原胞内已有6人参与

结构优化之后，原子跑到了邻近的单胞内，虽然只是沿着lattice vector 移动一下，并不改变系统的性质。但画图的时候不太好看，另外，我想研究原子在表面的扩散，这需要将初始和最终原子坐标对齐。
vasp 里能不能在优化结构的时候不去移动原子到隔壁的单胞内？
非常感谢！
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1楼2010-11-08 11:40:55
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skyscorpioa

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by haowenping at 2010-11-14 13:10:33:

这个应该是你在优化晶格常数的时候，为了找到能量最低态的时候发生的，你如果想保持哪个原子坐标不变要在优化晶格常数的时候，改变EN.sh 脚本

EN.sh 是什么？
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7楼2010-11-15 12:22:36
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xianggui7895

银虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
bingmou(金币+1):感谢交流 2010-11-08 18:17:30
画图的时候把他按照周期性边界条件拉回晶胞内不久行了吗？
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-11-08 17:08:15
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ym23(金币+1):谢谢交流 2010-11-08 23:26:12
不能在这方面加以限制，这样就不真实了。就是画图的时候处理一下就可以
赞一下(2人) 回复此楼
心之所向无惧无悔
3楼2010-11-08 18:37:20
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skyscorpioa

新虫 (初入文坛)
★
bingmou(金币+1):感谢交流 2010-11-11 14:48:23
以前用老板自己写的程序，可以选择固定不固定原胞中的原子的序号
现在转用vasp做扩散，看来是没有这个功能了
只能自己注意原子的对齐了
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4楼2010-11-11 06:57:11
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