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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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yidiandian2703

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助】vasp能否处理部分固定分子 已有3人参与

我想把某个分子之间的位置固定,也就是视分子为刚体,而整个分子又由于一起运动,不知道vasp有没有这样的功能?

多谢!
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qiqi2926

铜虫 (小有名气)

试试动力学。。。参考手册相关介绍
4楼2010-11-09 17:36:57
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+1):谢谢指点 2010-11-04 19:16:17
引用回帖:
Originally posted by yidiandian2703 at 2010-11-04 10:41:54:
我想把某个分子之间的位置固定,也就是视分子为刚体,而整个分子又由于一起运动,不知道vasp有没有这样的功能?

多谢!

基失后面的一行选用动态模式 (s开头)然后在原子坐标的后面写上FFT,如
sys
1
1 0 0
0 1 0
0 0 1
s
5
D
0  0  0  F F T #表示该原子的第一个和第二个坐标固定 第三个弛豫
嘟啦啦嘟啦啦嘟
2楼2010-11-04 14:47:59
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bnliu

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+1):谢谢回复!呵呵 2010-11-05 08:54:43
上面的方法是要弛豫哪个坐标,你要固定位置,就要求三个坐标都不动,应该不需要对坐标进行弛豫。
人生只有一次
3楼2010-11-05 08:48:18
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