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xiaobai216

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】继续讨论关于形成能的问题

以金刚石结构的64原子硅晶胞为例:

    在64-atom supercell中构建加入一个间隙位的氧原子,计算间隙氧原子的形成能。按照形成能公式

                                        Ef=E[Si64Oi]-sum_nμ,

其中E[Si64Oi]是掺杂后的缺陷体系的能量,n是体系中不同原子的个数,μ是体系中各种原子的化学势;则

                                       Ef=E[Si64Oi]-64E[Si]-E[Oi]

1. 这种计算方法正确吗?是否要考虑电价的影响即形成能公式中加入Q项?

2.如果采用这种计算方式的话,需要考虑原子的化学势,则:

    1) μ可用单个原子的能量来代替吗?计算Si的单原子能量能否用一个完整的硅晶胞     计算单点能后除以晶胞中的原子个数来得到?之前也有讨论说建立一个大的空立方格子,在格子中心放一个硅原子做能量计算,我比较了两种方法,发现所得的能量有比较大的差值;

    2)如果化学势可以用单个原子的能量来代替的话,那单个氧原子的能量怎么来计   算?之前有讨论说建立大的空格子在中心放一个氧分子,计算的能量后除以2得单个氧原子的能量,对吗?

[ Last edited by xiaobai216 on 2010-10-27 at 12:19 ]
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第一性原理新手...非常非常新
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xiaobai216

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by study163 at 2010-10-27 20:54:55:
对,计算氧分子的单点能的时候就是用空的晶胞。你计算单个si与计算si晶体时的计算参数 是一样的吗

就算单个硅时的k点是设置的Gamma点,而计算Si晶体时K点是MP2×2×2,是K点造成的差异吗?之前听人说过计算单个Si能量时K点只能设置成Gamma点。另外,氧分子怎么添加呢?直接Import是不可能的,没有O2.msi 吧,那该怎么添加两个氧原子的分子形式呢?
第一性原理新手...非常非常新
7楼2010-10-27 21:52:02
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cash_ms

木虫 (正式写手)

★ ★
bingmou(金币+2):感谢交流 2010-10-27 16:41:45
xiaobai216(金币+5):嗯,谢谢指教^_^ 2010-10-27 16:46:15
引用回帖:
Originally posted by xiaobai216 at 2010-10-27 11:47:39:
以金刚石结构的64原子硅晶胞为例:

    在64-atom supercell中构建加入一个间隙位的氧原子,计算间隙氧原子的形成能。按照形成能公式

                                        Ef=E[Si64Oi]-sum_nμ,

...

如果让我计算的话,我会按照公式
Ef=E[Si64O]-E[Si]-E[O]
其中E[Si64O]是填隙O原子之后的supercell的总能量
E[Si]是未填O原子之前含有64个Si原子的supercell的总能量
E[O]是单个O原子能量,可以采取计算大盒子里面放置单个氧原子的方式算出
2楼2010-10-27 15:19:28
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study163

木虫 (正式写手)

天生我材

★ ★
bingmou(金币+2):感谢参与 2010-10-27 16:42:08
xiaobai216(金币+5):谢谢指教,还有两个问题不大清楚... 2010-10-27 16:49:26
Ef=E[Si64Oi]-E[Si64]-E[Oi]

因为你讨论的是si64的吸附性质,所以要用si64的单点能作为参考能量。
另外计算单个硅原子能量可以计算硅晶体的总能,再除以每个晶胞中硅的数目。
氧原子的能量同样可以计算氧分子的能量,再除以二。计算氧分子的能量时,把氧分子放在一个大的晶胞里。
我的计算我做主
3楼2010-10-27 16:39:08
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xiaobai216

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by cash_ms at 2010-10-27 15:19:28:

如果让我计算的话,我会按照公式
Ef=E[Si64O]-E[Si]-E[O]
其中E[Si64O]是填隙O原子之后的supercell的总能量
E[Si]是未填O原子之前含有64个Si原子的supercell的总能量
E[O]是单个O原子能量,可以采取计算大盒 ...

嗯,我也同意用这种方法计算。关于单个原子的能量,我计算过单个Si原子的能量,分别是建立大的立方空胞,在空胞中心放一个硅原子和建立一个超胞后计算超胞总能除以超胞中的原子数得到的,但两者存在较大6 eV的能量差。请问哪一种方法更精确一些?
第一性原理新手...非常非常新
4楼2010-10-27 16:44:10
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