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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【讨论】关于如何优化大体系的问题
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chemzhh

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】关于如何优化大体系的问题 已有4人参与

大家看如下优化大体系的想法如何
1先用小基组对体系做一个优化，然后将其结果作为初始结构用大基组再次优化。这样做可行吗？能不能节省计算时间？我有点担心小基组计算的结果有时候会不会误入歧途，用作初始结构给大基组计算反而得不到真正的结果
2用小基组优化真实体系，或者用大基组优化简化后的体系(例如用PMe3代替PPh3)，或者对真实体系用ONIOM处理，这三者哪一种要好一些。我也觉得这个问题可能不能一概而论，想听一下大家的意见。
谢谢
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1楼 2010-10-18 18:09:12
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chemzhh

至尊木虫 (著名写手)
谢谢sobereva对这两个问题透彻的回答，我又联想到一个相关的问题。
用晶体结构的数据作为初始结构或在其基础上进行修改作为初始结构，是一个好方法吗，当然前提是有类似的晶体结构。
另外文献中经常有报道将计算的结果与晶体结构的键长、键角的数据进行比较，以此说明计算结果的准确性，这样做有意义吗？
我听到一种说法：晶体结构是堆积之后的结构，会与单个分子的结构有差别，当然晶体结构是固态中的结构，而计算的结构应该是在气相中优化的结果。
期待大家的热烈讨论。
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8楼2010-10-19 21:04:32
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
erylingjet(金币+3):感谢交流！ 2010-10-19 19:49:38
引用回帖:
Originally posted by chemzhh at 2010-10-18 18:09:12:
大家看如下优化大体系的想法如何
1先用小基组对体系做一个优化，然后将其结果作为初始结构用大基组再次优化。这样做可行吗？能不能节省计算时间？我有点担心小基组计算的结果有时候会不会误入歧途，用作初始结构 ...

如果你的机器够牛，就用全模型来做，计算方法只要能得到合理的结果就可以，不需要过高级别。
如果你的机器一般，建议你用简化模型来做，oniom省不了太多时间，并且说服力不够，还会遇到一些奇奇怪怪的问题。
最主要的还是idea。你随便翻翻前些年的jpcc jacs om，它们计算的方法或者说模型都很简单，但是人家提出了新的机理或者说新的概念。即使你再用超大基组，完整模型重复一下实验，得到了一些新的结果，也是借花献佛，失去了竞争力。
做paper第一是idea，第二是速度。

[ Last edited by manson1998 on 2010-10-18 at 18:26 ]
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惺惺相惜情不自禁
2楼2010-10-18 18:20:02
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chemzhh

至尊木虫 (著名写手)
谢谢manson的回答。那么第一个问题有没有意义，期待回答，谢谢
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3楼2010-10-18 19:47:03
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zhengpc3505

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2010-10-18 18:20:02:


       如果你的机器够牛，就用全模型来做，计算方法只要能得到合理的结果就可以，不需要过高级别。
如果你的机器一般，建议你用简化模型来做，oniom省不了太多时间，并且说服力不够，还会遇到一些奇奇怪怪的 ...

很有感触！！！
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4楼2010-10-19 00:37:17
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