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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【讨论】关于如何优化大体系的问题
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chemzhh

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】关于如何优化大体系的问题 已有4人参与

大家看如下优化大体系的想法如何
1先用小基组对体系做一个优化，然后将其结果作为初始结构用大基组再次优化。这样做可行吗？能不能节省计算时间？我有点担心小基组计算的结果有时候会不会误入歧途，用作初始结构给大基组计算反而得不到真正的结果
2用小基组优化真实体系，或者用大基组优化简化后的体系(例如用PMe3代替PPh3)，或者对真实体系用ONIOM处理，这三者哪一种要好一些。我也觉得这个问题可能不能一概而论，想听一下大家的意见。
谢谢
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1楼 2010-10-18 18:09:12
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by sobereva at 2010-10-19 18:14:45:
1 一般来说可行，也可以同时结合低级别理论方法，这种理念在高精度热力学组合方法中的优化步也有所体现。但对某些体系，低级别模型下无法哪怕定性地正确描述其结构特点（比如色散作用主导的构象），此时预优化是徒 ...

ONIOM也经常被质疑，对于100原子左右的中等体系，用混合基组貌似要比ONIOM划算的多。
简化模型时确实要注意各种情况，但是基本上能起到很好的抓住本质的作用。

[ Last edited by manson1998 on 2010-10-19 at 18:36 ]
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惺惺相惜情不自禁
7楼2010-10-19 18:29:27
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manson1998

金虫 (著名写手)

OLED达人
★ ★ ★ ★
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erylingjet(金币+3):感谢交流！ 2010-10-19 19:49:38
引用回帖:
Originally posted by chemzhh at 2010-10-18 18:09:12:
大家看如下优化大体系的想法如何
1先用小基组对体系做一个优化，然后将其结果作为初始结构用大基组再次优化。这样做可行吗？能不能节省计算时间？我有点担心小基组计算的结果有时候会不会误入歧途，用作初始结构 ...

如果你的机器够牛，就用全模型来做，计算方法只要能得到合理的结果就可以，不需要过高级别。
如果你的机器一般，建议你用简化模型来做，oniom省不了太多时间，并且说服力不够，还会遇到一些奇奇怪怪的问题。
最主要的还是idea。你随便翻翻前些年的jpcc jacs om，它们计算的方法或者说模型都很简单，但是人家提出了新的机理或者说新的概念。即使你再用超大基组，完整模型重复一下实验，得到了一些新的结果，也是借花献佛，失去了竞争力。
做paper第一是idea，第二是速度。

[ Last edited by manson1998 on 2010-10-18 at 18:26 ]
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惺惺相惜情不自禁
2楼2010-10-18 18:20:02
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chemzhh

至尊木虫 (著名写手)
谢谢manson的回答。那么第一个问题有没有意义，期待回答，谢谢
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3楼2010-10-18 19:47:03
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zhengpc3505

金虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
Originally posted by manson1998 at 2010-10-18 18:20:02:


       如果你的机器够牛，就用全模型来做，计算方法只要能得到合理的结果就可以，不需要过高级别。
如果你的机器一般，建议你用简化模型来做，oniom省不了太多时间，并且说服力不够，还会遇到一些奇奇怪怪的 ...

很有感触！！！
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4楼2010-10-19 00:37:17
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