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【求助】在Gaussianview中过渡金属形成的配位键如何表示，就用系统里的单键表示吗？已有4人参与
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在Gaussianview中过渡金属形成的配位键如何表示，就用上面的单键表示吗？ 还有，我对包含羰基的过度金属配合物采用b3lyp/lanl2dz（过度金属），3-21g（其他原子）优化后，过渡金属与羰基的键总是变成了双键！原来的构型里是单键的，一直比较困惑，是输入文件的问题，还是基组没有选对，有兴趣的虫虫指点一下，多谢！ |
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谢谢提供，您说的我看到了。这里我还有一个在运行高斯时遇到的，不知您有兴趣给俺说一下，我用如下输入文件 #p b3lyp/ gen pseudo=read opt 0 1 分子构型如下输入： Re C 1 B1 C 1 B2 2 A1 O 3 B3 1 A2 2 D1 O 2 B4 1 A3 3 D2 Cl 1 B5 2 A4 5 D3 C 1 B6 2 A5 5 D4 C 7 B7 1 A6 2 D5 C 7 B8 1 A7 2 D6 C 7 B9 1 A8 2 D7 C 8 B10 7 A9 1 D8 H 8 B11 7 A10 1 D9 C 9 B12 7 A11 1 D10 C 10 B13 7 A12 1 D11 H 10 B14 7 A13 1 D12 C 11 B15 8 A14 7 D13 H 11 B16 8 A15 7 D14 C 13 B17 9 A16 7 D15 H 14 B18 10 A17 7 D16 H 16 B19 11 A18 8 D17 C 18 B20 13 A19 9 D18 C 13 B21 9 A20 7 D19 H 21 B22 18 A21 13 D20 C 21 B23 18 A22 13 D21 H 22 B24 13 A23 9 D22 H 24 B25 21 A24 18 D23 N 16 B26 11 A25 8 D24 N 22 B27 13 A26 9 D25 C 1 B28 2 A27 5 D26 O 29 B29 1 A28 2 D27 B1 1.90343126 B2 1.97991537 B3 1.17970293 B4 1.19530177 B5 2.54602346 B6 4.37529900 B7 1.42037285 B8 1.42249247 B9 1.44559559 B10 1.39615220 B11 1.08634548 B12 1.43183404 B13 1.37589544 B14 1.08717433 B15 1.41142366 B16 1.08495457 B17 1.42223677 B18 1.08721617 B19 1.08234508 B20 1.42165439 B21 2.35068240 B22 1.08692047 B23 1.39539374 B24 1.08587367 B25 1.08482340 B26 1.35778961 B27 1.34899082 B28 1.97980369 B29 1.17971893 A1 88.46923496 A2 176.41934092 A3 177.27077958 A4 97.81091966 A5 115.53019610 A6 106.01919182 A7 11.91316692 A8 130.52793261 A9 118.75952887 A10 120.18232230 A11 120.05292644 A12 121.25244346 A13 118.29801024 A14 120.28619281 A15 121.21107908 A16 120.59064361 A17 120.49827131 A18 120.98391300 A19 117.46024521 A20 146.93870937 A21 119.86179783 A22 119.30164209 A23 146.54253809 A24 121.22362404 A25 122.52719023 A26 30.85955052 A27 88.47141497 A28 176.40265550 D1 58.58089102 D2 94.62895961 D3 -179.96572506 D4 0.03457272 D5 0.00299300 D6 -179.99592871 D7 -179.99620313 D8 0.00000000 D9 -180.00000000 D10 -180.00000000 D11 0.00000000 D12 -180.00000000 D13 0.00000000 D14 -180.00000000 D15 0.00000000 D16 180.00000000 D17 -180.00000000 D18 -180.00000000 D19 -180.00000000 D20 -180.00000000 D21 0.00000000 D22 0.00000000 D23 180.00000000 D24 0.00000000 D25 0.00000000 D26 -94.57091976 D27 -58.66339592 1 2 1.0 3 1.0 29 1.0 28 1.0 27 1.0 6 1.0 2 5 2.0 3 4 2.0 4 5 6 7 8 1.5 9 1.5 10 1.5 8 11 1.5 12 1.0 9 13 1.5 27 1.0 10 14 2.0 15 1.0 11 16 1.5 17 1.0 12 13 18 1.5 28 1.5 14 18 1.5 19 1.0 15 16 20 1.0 27 1.5 17 18 21 1.5 19 20 21 23 1.0 24 1.5 22 24 1.5 25 1.0 28 1.5 23 24 26 1.0 25 26 27 28 29 30 2.0 30 Re 0 lanl2dz **** H C N O Cl 0 3-21g **** Re 0 lanl2dz 这样输入，高斯提示无法运行！ 然后分子构型我采用如下输入，却可以，不知道为什么。 Re C 1 B1 C 1 B2 2 A1 O 3 B3 1 A2 2 D1 O 2 B4 1 A3 3 D2 Cl 1 B5 2 A4 5 D3 C 1 B6 2 A5 5 D4 C 7 B7 1 A6 2 D5 C 7 B8 1 A7 2 D6 C 7 B9 1 A8 2 D7 C 8 B10 7 A9 1 D8 H 8 B11 7 A10 1 D9 C 9 B12 7 A11 1 D10 C 10 B13 7 A12 1 D11 H 10 B14 7 A13 1 D12 C 11 B15 8 A14 7 D13 H 11 B16 8 A15 7 D14 C 13 B17 9 A16 7 D15 H 14 B18 10 A17 7 D16 H 16 B19 11 A18 8 D17 C 18 B20 13 A19 9 D18 C 13 B21 9 A20 7 D19 H 21 B22 18 A21 13 D20 C 21 B23 18 A22 13 D21 H 22 B24 13 A23 9 D22 H 24 B25 21 A24 18 D23 N 16 B26 11 A25 8 D24 N 22 B27 13 A26 9 D25 C 1 B28 2 A27 5 D26 O 29 B29 1 A28 2 D27 B1 1.90343126 B2 1.97991537 B3 1.17970293 B4 1.19530177 B5 2.54602346 B6 4.37529900 B7 1.42037285 B8 1.42249247 B9 1.44559559 B10 1.39615220 B11 1.08634548 B12 1.43183404 B13 1.37589544 B14 1.08717433 B15 1.41142366 B16 1.08495457 B17 1.42223677 B18 1.08721617 B19 1.08234508 B20 1.42165439 B21 2.35068240 B22 1.08692047 B23 1.39539374 B24 1.08587367 B25 1.08482340 B26 1.35778961 B27 1.34899082 B28 1.97980369 B29 1.17971893 A1 88.46923496 A2 176.41934092 A3 177.27077958 A4 97.81091966 A5 115.53019610 A6 106.01919182 A7 11.91316692 A8 130.52793261 A9 118.75952887 A10 120.18232230 A11 120.05292644 A12 121.25244346 A13 118.29801024 A14 120.28619281 A15 121.21107908 A16 120.59064361 A17 120.49827131 A18 120.98391300 A19 117.46024521 A20 146.93870937 A21 119.86179783 A22 119.30164209 A23 146.54253809 A24 121.22362404 A25 122.52719023 A26 30.85955052 A27 88.47141497 A28 176.40265550 D1 58.58089102 D2 94.62895961 D3 -179.96572506 D4 0.03457272 D5 0.00299300 D6 -179.99592871 D7 -179.99620313 D8 0.00000000 D9 -180.00000000 D10 -180.00000000 D11 0.00000000 D12 -180.00000000 D13 0.00000000 D14 -180.00000000 D15 0.00000000 D16 180.00000000 D17 -180.00000000 D18 -180.00000000 D19 -180.00000000 D20 -180.00000000 D21 0.00000000 D22 0.00000000 D23 180.00000000 D24 0.00000000 D25 0.00000000 D26 -94.57091976 D27 -58.66339592 Re 0 lanl2dz **** H C N O Cl 0 3-21g **** Re 0 lanl2dz |
6楼2010-10-05 08:15:29
zhangmt
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http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146 这是GaussianFAQ的网址 打开之后先看第三章第一节 你的问题就得到解答了 |
4楼2010-10-04 15:58:09