24小时热门版块排行榜    

查看: 4590  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhaojy008

金虫 (小有名气)

彩色风

[交流] 【求助】计算吸附能

利用CASPET程度优化晶体结构以计算吸附能。计算吸附能的一般公式为:E=Ecomplex-(Esurface+Ereagent),Ecomplex吸附络合模型能量,Esurface为被吸附表面模型能量,Ereagent吸附剂模型能量,前两者可以在程序中结构优化后得到,而后者为单个分子,如何得到它的能量,请教各位大师。
回复此楼
彩色风
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hgye

金虫 (小有名气)


zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-24 11:48:33
引用回帖:
Originally posted by goldenfisher at 2010-09-23 23:35:02:


如果周期结构的体积太小,你计算的同样不是单分子的吸附。

吸附当然存在覆盖度的问题,但不管覆盖度是多少,算吸附能时减去的分子能量必须是独立自由分子的能量,不能包含近邻相互作用,不同的覆盖度要保持一致,用同一个值。按你的算法,随着覆盖度不同用不同的cell算分子能量,值肯定有所变化。
7楼2010-09-24 09:14:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

hgye

金虫 (小有名气)

★ ★
zhaojy008(金币+1):谢谢参与
zhaojy008(金币+1): 2010-09-22 18:36:23
zzy870720z(金币+1):谢谢指教 2010-09-22 23:35:07
建立一个足够大的cell,如10x11x12,把分子放里边算就可以得到能量。
2楼2010-09-22 18:32:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldenfisher

金虫 (著名写手)

★ ★
zhaojy008(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):谢谢指点 2010-09-22 23:35:26
最好是放在你的complex相同大小的盒子里面进行计算,这样可以避免一些系统误差
3楼2010-09-22 21:29:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hgye

金虫 (小有名气)


zxzj05(金币+1):谢谢参与 2010-09-23 10:58:07
引用回帖:
Originally posted by goldenfisher at 2010-09-22 21:29:18:
最好是放在你的complex相同大小的盒子里面进行计算,这样可以避免一些系统误差

如果周期单元的表面积很小,这样算就会引入了紧邻分子和分子之间的相互作用,所得能量就不是一个自由分子的能量
4楼2010-09-23 10:19:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +6 生物工程调剂 2026-03-17 10/500 2026-03-22 20:22 by edmund7
[考研] 求调剂一志愿海大,0703化学学硕304分,有大创项目,四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-21 3/150 2026-03-22 16:54 by i_cooler
[考研] 324求调剂 +6 lucky呀呀呀鸭 2026-03-20 6/300 2026-03-22 16:01 by ColorlessPI
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +7 Auroracx 2026-03-22 7/350 2026-03-22 12:38 by 素颜倾城1988
[考研] 考研调剂 +4 来好运来来来 2026-03-21 4/200 2026-03-22 12:15 by 星空星月
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 工科0856求调剂 +3 沐析汀汀 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:30 by 学员8dgXkO
[考研] 材料工程(专)一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 Ma_xt 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:05 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +8 简木ChuFront 2026-03-19 8/400 2026-03-20 20:44 by zhukairuo
[考研] 261求B区调剂,科研经历丰富 +3 牛奶很忙 2026-03-20 4/200 2026-03-20 19:34 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工专硕调剂 +7 heming3743 2026-03-16 7/350 2026-03-20 19:31 by zhukairuo
[考研] 081700化工学硕调剂 +3 【1】 2026-03-16 3/150 2026-03-19 23:40 by edmund7
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[考研] 本科郑州大学物理学院,一志愿华科070200学硕,346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
信息提示
请填处理意见