应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】计算吸附能
101/1返回列表
查看: 4581  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhaojy008

金虫 (小有名气)

彩色风

[交流] 【求助】计算吸附能

利用CASPET程度优化晶体结构以计算吸附能。计算吸附能的一般公式为：E=Ecomplex-(Esurface+Ereagent)，Ecomplex吸附络合模型能量，Esurface为被吸附表面模型能量，Ereagent吸附剂模型能量，前两者可以在程序中结构优化后得到，而后者为单个分子，如何得到它的能量，请教各位大师。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
彩色风
1楼 2010-09-22 17:58:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hgye

金虫 (小有名气)
★ ★
zhaojy008(金币+1):谢谢参与
zhaojy008(金币+1): 2010-09-22 18:36:23
zzy870720z(金币+1):谢谢指教 2010-09-22 23:35:07
建立一个足够大的cell，如10x11x12，把分子放里边算就可以得到能量。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-09-22 18:32:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldenfisher

金虫 (著名写手)
★ ★
zhaojy008(金币+1):谢谢参与
zzy870720z(金币+1):谢谢指点 2010-09-22 23:35:26
最好是放在你的complex相同大小的盒子里面进行计算，这样可以避免一些系统误差
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-09-22 21:29:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hgye

金虫 (小有名气)
★
zxzj05(金币+1):谢谢参与 2010-09-23 10:58:07
引用回帖:
Originally posted by goldenfisher at 2010-09-22 21:29:18:
最好是放在你的complex相同大小的盒子里面进行计算，这样可以避免一些系统误差

如果周期单元的表面积很小，这样算就会引入了紧邻分子和分子之间的相互作用，所得能量就不是一个自由分子的能量
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-09-23 10:19:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

goldenfisher

金虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by hgye at 2010-09-23 10:19:47:

如果周期单元的表面积很小，这样算就会引入了紧邻分子和分子之间的相互作用，所得能量就不是一个自由分子的能量

如果周期结构的体积太小，你计算的同样不是单分子的吸附。
赞一下 回复此楼
5楼2010-09-23 23:35:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmzhang86

木虫 (著名写手)
★
zhaojy008(金币+1):谢谢参与
正在做  很受启发
回复此楼
6楼2010-09-23 23:51:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hgye

金虫 (小有名气)
★
zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-24 11:48:33
引用回帖:
Originally posted by goldenfisher at 2010-09-23 23:35:02:


如果周期结构的体积太小，你计算的同样不是单分子的吸附。

吸附当然存在覆盖度的问题，但不管覆盖度是多少，算吸附能时减去的分子能量必须是独立自由分子的能量，不能包含近邻相互作用，不同的覆盖度要保持一致，用同一个值。按你的算法，随着覆盖度不同用不同的cell算分子能量，值肯定有所变化。
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2010-09-24 09:14:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feass2

金虫 (小有名气)
★ ★
zhaojy008(金币+1):谢谢参与
zxzj05(金币+1):谢谢回帖交流 2010-09-24 11:48:41
引用回帖:
Originally posted by goldenfisher at 2010-09-22 21:29:18:
最好是放在你的complex相同大小的盒子里面进行计算，这样可以避免一些系统误差

单纯计算吸附能（结合能），一般是将单个原子（分子）"放在1nm立方晶格内计算”，可以说绝大部分文献都是这么做的。如果计算形变能，反应能，可参考这个帖子：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1704823
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2010-09-24 10:39:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

9443minmin

禁虫 (小有名气)
★
zhaojy008(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽
9楼2018-11-28 20:35:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yanbodr
★
zhaojy008(金币+1): 谢谢参与


发自小木虫Android客户端
10楼2018-11-28 22:25:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhaojy008 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考！ +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 材料工程专硕 348分求调剂 +3 冬辞. 2026-03-17 5/250 2026-03-21 18:47 by 学员8dgXkO
[考研] 【考研调剂】化学专业 281分，一志愿四川大学，诚心求调剂 +11 吃吃吃才有意义 2026-03-19 11/550 2026-03-21 18:23 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 299求调剂 +4 某某某某位 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:30 by barlinike
[考研] 材料与化工（0856）304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 求调剂 +3 白QF 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:12 by zhukairuo
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 306求调剂 +4 chuanzhu川烛 2026-03-18 4/200 2026-03-21 08:25 by laoshidan
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-16 3/150 2026-03-21 03:59 by JourneyLucky
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂 +12 yangfz 2026-03-17 12/600 2026-03-21 03:30 by JourneyLucky
[考研] 085700资源与环境308求调剂 +12 墨墨漠 2026-03-18 13/650 2026-03-21 01:42 by JourneyLucky
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +4 llllkkkhh 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:24 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 冬十三 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:16 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭