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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 【求助成功】固定边界问题
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主优秀版主

[交流] 【求助成功】固定边界问题 已有5人参与

我想模拟一个固定盒子中原子的行为
当我把boundary设置成s s s时就提示我lost atoms
应该是有些原子飞出盒子了
为了避免原子飞出
manual上查到可以用fix wall/reflect来把原子束缚到盒子中
然后我就添加了如下设置
fix             walls all wall/reflect xlo EDGE xhi EDGE ylo EDGE yhi EDGE zlo EDGE zhi EDGE
改了之后就提示我
Illegal fix wall/reflect command
大家有谁遇到过或者知道如何解决？
用的15 Jan 2010版
期待高手

[ Last edited by zzy870720z on 2010-9-16 at 09:45 ]
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
1楼 2010-09-15 11:28:27
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+3):谢谢 2010-09-15 17:12:51
zzy870720z(金币+2):谢谢提示 2010-09-16 09:44:38
请更新程序版本。原子丢失是不正常现象，也许是边界条件的问题，也许不是边界条件的题。
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4楼2010-09-15 17:05:56
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ghcacj

荣誉版主 (著名写手)

阿超

优秀版主
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢提示，用的是lammps，呵呵。忘了说了，以为发到lammps子版就可以了。呵呵 2010-09-16 09:43:50
问题其实问的很详细了，但是最好将软件的名称说出来，这样便于我们的专家来回答。
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2楼2010-09-15 14:06:04
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362720651

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-09-15 15:40:06
zzy870720z(金币+5):谢谢，问题解决，看起来我用的手册和版本对不上了，呵呵 2010-09-16 09:44:27
哦 呵呵 这个版本的时候 肯定不是现在这个命令啦
不用加EDGE吧
直接fix             walls all wall/reflect xlo  xhi  ylo  yhi  zlo  zhi
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3楼2010-09-15 15:20:30
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-09-15 19:48:45
zzy870720z(金币+1):这个问题可以讨论一下，呵呵 2010-09-16 09:44:57
一个问题：

MD模拟中固定边界是否会影响体系的总动量守恒？
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5楼2010-09-15 19:39:45
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