| 查看: 2235 | 回复: 7 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
azengjuan铁虫 (小有名气)
|
[交流]
【讨论】含有配位键的金属原子在gaussian中如何计算单点能
|
||
大家好，我想用gaussian计算一个含ligand的蛋白体系的单点能，ligand的部分如图： ，ligand和蛋白之间存在化学键，有谁知道我该怎么处理，谢谢 |
回复此楼» 猜你喜欢
西南某211招27届博士
已经有33人回复
-
大连工业杰青/长江团队-生物质材料-储能电池方向招收2026级博士生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有200人回复
-
深圳大学高等研究院赵伟课题组招收化学调剂生
已经有3人回复
-
青岛大学固态电池研究团队招收材料、化学、物理等方向博士研究生
已经有32人回复
-
化学工程085602 305分求调剂
已经有17人回复
-
26博士申请
已经有0人回复
-
武汉纺织大学全国重点实验室杨应奎教授团队拟招17-19位硕博生！
已经有0人回复
-
材料与化工专硕接受跨专业调剂（重庆市属高校）
已经有0人回复
-
武汉纺织大学全国重点实验室杨应奎教授团队拟招17-19位硕博生！
已经有0人回复
-
上海工程技术大学生态与功能纺织品开发研究团队招收学硕专硕研究生
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Gaussian几何优化后的键长不合理
已经有41人回复
- 求高斯计算中配位键如何画
已经有3人回复
- 【整理】今天整理硬盘上的资料，偶然发现的好玩的小东西就直接发上来吧
已经有105人回复
- 【求助】在Gaussianview中过渡金属形成的配位键如何表示，就用系统里的单键表示吗？
已经有9人回复
- 【分享】学习小结，高手不必进啊
已经有7人回复
- 【sobereva个人文集】电子定域性的图形分析
已经有56人回复
- 【求助】金属配合物
已经有3人回复
- 【求助】前线轨道研究反应选择性的问题
已经有24人回复
azengjuan
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 650.5
- 散金: 106
- 帖子: 65
- 在线: 78.7小时
- 虫号: 1058464
- 注册: 2010-07-15
- 专业: 生物大分子结构与功能
5楼2010-09-15 09:35:19
azengjuan
铁虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 650.5
- 散金: 106
- 帖子: 65
- 在线: 78.7小时
- 虫号: 1058464
- 注册: 2010-07-15
- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2010-09-14 09:54:06
azengjuan(金币+5): 2010-09-15 09:33:45
| 看你关注的核心结构是什么。oniom可以进行分子力学/量子力学的混合计算。也就是对体系的不重要的部分(外层)采用低级别的计算方法(如分子力学MM),对体系的重要的部分(内层)采用高级别的计算方法(当然也可以分为三层，内中外)。这样可以大大减小计算量。 对于你的体系，建议你将ligand、蛋白的活性部位以及ligand和蛋白相连的部位化作内层用量化的方法计算(DFT/B3LYP),其他部分作外层用MM方法。必要的话可以尝试优化一下得到合理结构的单点能。 ONIOM的方法在gaussian里有，具体说明可参看手册。 |
4楼2010-09-14 10:03:49
小丁0912
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1443.1
- 散金: 343
- 红花: 5
- 沙发: 1
- 帖子: 362
- 在线: 144.3小时
- 虫号: 1074893
- 注册: 2010-08-15
- 专业: 高分子合成化学
6楼2010-09-17 18:54:29
