| 查看: 609 | 回复: 4 | |||
lct515新虫 (著名写手)
|
[交流]
【求助/交流】有关NCBI数据库！ 已有3人参与
|
| 我想考察铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）是否能够分泌脂肪酶（Triacylglycerol lipase E C3.1.1.3），也想知道它是否还能分泌其他种类的酶，有人告诉我可以在NCBI中查找铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）的基因片段，看其是否有编码脂肪酶的基因，但我不知道该如何操作，请高手指点！ |
回复此楼» 猜你喜欢
一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂
已经有10人回复
-
一志愿吉林大学材料学硕321求调剂
已经有8人回复
-
一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂
已经有6人回复
-
一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂
已经有3人回复
-
332求调剂
已经有3人回复
-
294求调剂材料与化工专硕
已经有7人回复
-
281求调剂（0805）
已经有17人回复
-
267一志愿南京工业大学0817化工求调剂
已经有10人回复
-
0817调剂
已经有3人回复
-
焦虑
已经有13人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助关于向Genbank提交序列的大小以及时间点等
已经有3人回复
- 关于Blast的用法
已经有5人回复
- NCBI数据库里给出的蛋白分子量时整个蛋白分子量还是一个亚基分子量呢
已经有9人回复
- NCBI中SRA数据库相关求助
已经有3人回复
- 如何将Genbank序列导入BEAST或BEAUti软件
已经有7人回复
- GenBank 上提交新基因的氨基酸序列 一般需要多久才能录进NCBI数据库上
已经有11人回复
- 进化树及序列上传相关问题
已经有9人回复
- 有关PDB数据库的使用问题
已经有11人回复
- 怎样在NCBI中查找一物种的全基因组？
已经有12人回复
- 【教程】NCBI、blast相关教程
已经有233人回复
- 向NCBI提交序列问题
已经有8人回复
- 【资料】搞蛋白质的童鞋们，甭要只查NCBI了~蛋白质相关数据库启蒙~
已经有135人回复
- 求助-基因克隆有关方面内容
已经有8人回复
- 关于NCBI中dbSNP数据库的问题，非常期待和感谢大家的回答
已经有4人回复
- 【求助/交流】关于ncbi上比对结果的问题
已经有6人回复
- 生物信息学专题－生物版，医学版和信息科学版共同创建
已经有87人回复
lct515
新虫 (著名写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 4651.2
- 散金: 917
- 红花: 4
- 帖子: 1065
- 在线: 202.7小时
- 虫号: 59753
- 注册: 2005-03-02
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
2楼2010-09-13 11:28:30
cnlics
木虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 3014.2
- 红花: 4
- 帖子: 270
- 在线: 422.4小时
- 虫号: 795158
- 注册: 2009-06-16
- 性别: GG
- 专业: 当代宗教
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
|
方法有几种，第一种：除支原体等特殊细菌外，细菌基因组一般3M bp左右，含有3000个左右的基因，数据量不大。可以先下载基因组，将数据导入excel中，然后按照关键词enzyme找，可能会有hypothsized enzyme，需要自己进一步判断。这种方法可以找到全部想要的序列，还有超出需要的序列。 第二种，在NCBI中利用Entrez查询系统利用关键词lipase去找铜绿假单胞菌。这种方法会遗漏一些酶。 第三种，随便找个lipse序列，通过blast分析，结果中会出现你要的结果。这种方法会发现第二种方法中遗漏的酶，但总体结果会比第二种方法少很多。 |
3楼2010-09-13 12:39:24
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
  |
4楼2010-09-26 17:03:03
 |
5楼2010-09-26 17:04:38
