24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 668  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

songxing0417

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[交流] 【求助】CIF中是否少这一项

请各位高手帮忙看一下,我看晶体学报E模板最后有这样一项:
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
_geom_hbond_publ_flag
O H1O Cl  0.833(10) 2.306(14) 3.114(2) 163(3) 2_566 y
N H1C Cl  0.873(10) 2.756(18) 3.560(3) 154(3) 1_565 y
N H1D Cl  0.869(10) 2.574(13) 3.422(3) 165(3) 2_566 y
但我的CIF文件中没有这一项,这是关于氢键的吗?按说我的应该有氢键啊,结构式如下:,这是什么原因呢,请高手指点,谢谢了!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songxing0417

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
Originally posted by phoeby_ice at 2010-09-06 15:37:05:


我没能直接复制进去,是这么做的...
在右边窗口点右键,选择table wizard,里面选择氢键
然后对应把数据一个一个输入进去
ARU对应的是symmetry,写在symmetry A那栏,如2656写成2_656就好
填完add to cif ...

不好意思,还要麻烦您,你看最上面那个模板中都有不确定性,小括号中的数字,我的里面没有,还是我不会找啊,我没写,结果一大堆A类错误,请问一下这个在哪里找啊,还是可以自己随便写啊?谢谢了!
5楼2010-09-06 15:58:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

phoeby_ice

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!


nash603(金币+1):谢谢回贴交流! 2010-09-06 11:52:03
songxing0417(金币+1): 2010-09-06 14:39:56
用platon查看氢键,在pubcif里再把氢键数据加进去
2楼2010-09-06 11:26:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songxing0417

管理员

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
Originally posted by phoeby_ice at 2010-09-06 11:26:33:
用platon查看氢键,在pubcif里再把氢键数据加进去

您好,我得到的是下面的,请问直接复制进去吗,还有有的东西不需要复制啊,前面的数字标号要写吗,还有[    ARU  ] 要写吗,麻烦您了,谢谢!
Nr Typ Res Donor --- H....Acceptor [    ARU  ]      D - H      H...A      D...A  D - H...A    A..H..A* A'..H..A" Sum(XY,YZ)  Sum(XZ)
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
1       1 N(1)  --H(1A)  ..O(2)   [  1455.01]       0.86       2.11     2.9388        163
2       1 N(1)  --H(1B)  ..O(3)   [  2564.01]       0.86       2.17     3.0264        175
3       1 N(2)  --H(2C)  ..O(4)   [  2564.02]       0.86       2.54     3.1672        131
4       1 N(2)  --H(2D)  ..O(1)   [  3565.01]       0.86       2.09     2.8918        155
         1 N(3)  --H(3A)  .. ?                       0.86
5       1 N(3)  --H(3B)  ..O(4)   [  4555.02]       0.86       2.15     2.9452        153
6       2 O(4)  --H(4C)  ..O(2)   [  2565.01]       0.82       1.97     2.7546        160

7       1 C(2)  --H(2A)  ..O(2)   [  2565.01]       0.97       2.54     3.4287        152
8 Intra 1 C(6)  --H(6A)  ..N(3)   [         ]       0.98       2.50     2.8938        104
9 Intra 1 C(13) --H(13A) ..O(2)   [         ]       0.98       2.34     2.8455        111
10 Intra 1 C(14) --H(14A) ..O(1)   [         ]       0.98       2.37     2.8704        111
3楼2010-09-06 14:39:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

phoeby_ice

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

songxing0417(金币+1): 2010-09-06 15:56:29
引用回帖:
Originally posted by songxing0417 at 2010-09-06 14:39:44:

您好,我得到的是下面的,请问直接复制进去吗,还有有的东西不需要复制啊,前面的数字标号要写吗,还有[    ARU  ] 要写吗,麻烦您了,谢谢!
Nr Typ Res Donor --- H....Acceptor [    ARU  ]      D - H     ...

我没能直接复制进去,是这么做的...
在右边窗口点右键,选择table wizard,里面选择氢键
然后对应把数据一个一个输入进去
ARU对应的是symmetry,写在symmetry A那栏,如2656写成2_656就好
填完add to cif,ok!
4楼2010-09-06 15:37:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856材料与化工调剂,339 +9 10213207 2026-03-31 9/450 2026-04-01 00:49 by fmesaito
[考研] 调剂申请 +7 张张张张zy 2026-03-31 7/350 2026-03-31 22:25 by piaoyi415
[考研] 材料科学与工程求调剂 +13 深V宿舍吧 2026-03-29 13/650 2026-03-31 19:50 by Dyhoer
[考研] 张芳铭-中国农业大学-环境工程专硕-298 +9 手机用户 2026-03-26 9/450 2026-03-31 18:09 by 544594351
[考研] 求调剂 生物学 377分 +6 zzll03 2026-03-31 6/300 2026-03-31 17:33 by 唐沐儿
[考研] 285求调剂 +6 AZMK 2026-03-30 11/550 2026-03-31 17:33 by AZMK
[考研] 江苏苏北高校诚邀调剂同学 +3 zzll406 2026-03-31 3/150 2026-03-31 16:54 by 及时行乐fan
[考研] 材料求调剂 一志愿哈工大总分298分,前三科223分 +11 dongfang59 2026-03-27 11/550 2026-03-31 16:51 by Wang200018
[考研] 322求调剂:一志愿湖南大学 材料与化工(085600),已过六级。 +10 XX小邓 2026-03-29 10/500 2026-03-31 16:46 by 不吃魚的貓
[考研] 330分求调剂 +6 qzenlc 2026-03-29 6/300 2026-03-31 16:44 by Wang200018
[考研] 材料科学与工程调剂 +13 深V宿舍吧 2026-03-30 14/700 2026-03-31 16:28 by hypershenger
[考研] 282求调剂 不挑专业 求收留 +4 Yam. 2026-03-30 5/250 2026-03-31 14:41 by 王亮_大连医科大
[考研] 本科211安全工程,初试290分,求调剂 +3 2719846834 2026-03-28 3/150 2026-03-31 13:52 by 热情沙漠
[考研] 328求调剂 +8 嗯滴的基本都 2026-03-27 8/400 2026-03-30 17:20 by Wang200018
[考研] 303求调剂 +7 DLkz1314. 2026-03-30 7/350 2026-03-30 16:05 by shuang5186
[考研] 085602 化学工程专硕 340分求调剂 +4 qianbai11 2026-03-29 4/200 2026-03-30 11:34 by 唐沐儿
[考研] 337求调剂 +6 《树》 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:15 by herarysara
[考研] 085600,专业课化工原理,321分求调剂 +5 大馋小子 2026-03-28 5/250 2026-03-29 08:56 by qingfeng258
[考研] 295求调剂 +5 1428151015 2026-03-27 6/300 2026-03-28 04:04 by fmesaito
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
信息提示
请填处理意见