应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 文献解析 » 【求助】CIF中是否少这一项
51/1返回列表
查看: 818  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

songxing0417

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】CIF中是否少这一项

请各位高手帮忙看一下，我看晶体学报E模板最后有这样一项：
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
_geom_hbond_publ_flag
O H1O Cl  0.833(10) 2.306(14) 3.114(2) 163(3) 2_566 y
N H1C Cl  0.873(10) 2.756(18) 3.560(3) 154(3) 1_565 y
N H1D Cl  0.869(10) 2.574(13) 3.422(3) 165(3) 2_566 y
但我的CIF文件中没有这一项，这是关于氢键的吗？按说我的应该有氢键啊，结构式如下：，这是什么原因呢，请高手指点，谢谢了！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-09-06 10:17:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

phoeby_ice

金虫 (小有名气)
songxing0417(金币+1): 2010-09-06 15:56:29
引用回帖:
Originally posted by songxing0417 at 2010-09-06 14:39:44:

您好，我得到的是下面的，请问直接复制进去吗，还有有的东西不需要复制啊，前面的数字标号要写吗，还有[    ARU  ] 要写吗，麻烦您了，谢谢！
Nr Typ Res Donor --- H....Acceptor [    ARU  ]      D - H     ...

我没能直接复制进去，是这么做的...
在右边窗口点右键，选择table wizard，里面选择氢键
然后对应把数据一个一个输入进去
ARU对应的是symmetry，写在symmetry A那栏，如2656写成2_656就好
填完add to cif，ok！
赞一下 回复此楼
4楼2010-09-06 15:37:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

phoeby_ice

金虫 (小有名气)
★
nash603(金币+1):谢谢回贴交流！ 2010-09-06 11:52:03
songxing0417(金币+1): 2010-09-06 14:39:56
用platon查看氢键，在pubcif里再把氢键数据加进去
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-09-06 11:26:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songxing0417

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by phoeby_ice at 2010-09-06 11:26:33:
用platon查看氢键，在pubcif里再把氢键数据加进去

您好，我得到的是下面的，请问直接复制进去吗，还有有的东西不需要复制啊，前面的数字标号要写吗，还有[    ARU  ] 要写吗，麻烦您了，谢谢！
Nr Typ Res Donor --- H....Acceptor [    ARU  ]      D - H      H...A      D...A  D - H...A    A..H..A* A'..H..A" Sum(XY,YZ)  Sum(XZ)
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
1       1 N(1)  --H(1A)  ..O(2)   [  1455.01]       0.86       2.11     2.9388        163
2       1 N(1)  --H(1B)  ..O(3)   [  2564.01]       0.86       2.17     3.0264        175
3       1 N(2)  --H(2C)  ..O(4)   [  2564.02]       0.86       2.54     3.1672        131
4       1 N(2)  --H(2D)  ..O(1)   [  3565.01]       0.86       2.09     2.8918        155
         1 N(3)  --H(3A)  .. ?                       0.86
5       1 N(3)  --H(3B)  ..O(4)   [  4555.02]       0.86       2.15     2.9452        153
6       2 O(4)  --H(4C)  ..O(2)   [  2565.01]       0.82       1.97     2.7546        160

7       1 C(2)  --H(2A)  ..O(2)   [  2565.01]       0.97       2.54     3.4287        152
8 Intra 1 C(6)  --H(6A)  ..N(3)   [         ]       0.98       2.50     2.8938        104
9 Intra 1 C(13) --H(13A) ..O(2)   [         ]       0.98       2.34     2.8455        111
10 Intra 1 C(14) --H(14A) ..O(1)   [         ]       0.98       2.37     2.8704        111
赞一下 回复此楼
3楼2010-09-06 14:39:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

songxing0417

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by phoeby_ice at 2010-09-06 15:37:05:


我没能直接复制进去，是这么做的...
在右边窗口点右键，选择table wizard，里面选择氢键
然后对应把数据一个一个输入进去
ARU对应的是symmetry，写在symmetry A那栏，如2656写成2_656就好
填完add to cif ...

不好意思，还要麻烦您，你看最上面那个模板中都有不确定性，小括号中的数字，我的里面没有，还是我不会找啊，我没写，结果一大堆A类错误，请问一下这个在哪里找啊，还是可以自己随便写啊？谢谢了！
赞一下 回复此楼
5楼2010-09-06 15:58:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +14 angus9576 2026-08-25 17/850 2026-08-25 20:24 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 19/950 2026-08-25 17:57 by chick875
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 +6 ziyangfang 2026-08-25 8/400 2026-08-25 16:28 by 宝贝的猪
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 科研孤儿太难了 +18 我4大白菜 2026-08-20 19/950 2026-08-24 09:47 by 凯恩广盛催化分�
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭