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[交流]
【求助】CIF中是否少这一项
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请各位高手帮忙看一下，我看晶体学报E模板最后有这样一项： loop_ _geom_hbond_atom_site_label_D _geom_hbond_atom_site_label_H _geom_hbond_atom_site_label_A _geom_hbond_distance_DH _geom_hbond_distance_HA _geom_hbond_distance_DA _geom_hbond_angle_DHA _geom_hbond_site_symmetry_A _geom_hbond_publ_flag O H1O Cl 0.833(10) 2.306(14) 3.114(2) 163(3) 2_566 y N H1C Cl 0.873(10) 2.756(18) 3.560(3) 154(3) 1_565 y N H1D Cl 0.869(10) 2.574(13) 3.422(3) 165(3) 2_566 y 但我的CIF文件中没有这一项，这是关于氢键的吗？按说我的应该有氢键啊，结构式如下：  ，这是什么原因呢，请高手指点，谢谢了！ |
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phoeby_ice
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2楼2010-09-06 11:26:33
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您好，我得到的是下面的，请问直接复制进去吗，还有有的东西不需要复制啊，前面的数字标号要写吗，还有[ ARU ] 要写吗，麻烦您了，谢谢！ Nr Typ Res Donor --- H....Acceptor [ ARU ] D - H H...A D...A D - H...A A..H..A* A'..H..A" Sum(XY,YZ) Sum(XZ) ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 1 1 N(1) --H(1A) ..O(2) [ 1455.01] 0.86 2.11 2.9388 163 2 1 N(1) --H(1B) ..O(3) [ 2564.01] 0.86 2.17 3.0264 175 3 1 N(2) --H(2C) ..O(4) [ 2564.02] 0.86 2.54 3.1672 131 4 1 N(2) --H(2D) ..O(1) [ 3565.01] 0.86 2.09 2.8918 155 1 N(3) --H(3A) .. ? 0.86 5 1 N(3) --H(3B) ..O(4) [ 4555.02] 0.86 2.15 2.9452 153 6 2 O(4) --H(4C) ..O(2) [ 2565.01] 0.82 1.97 2.7546 160 7 1 C(2) --H(2A) ..O(2) [ 2565.01] 0.97 2.54 3.4287 152 8 Intra 1 C(6) --H(6A) ..N(3) [ ] 0.98 2.50 2.8938 104 9 Intra 1 C(13) --H(13A) ..O(2) [ ] 0.98 2.34 2.8455 111 10 Intra 1 C(14) --H(14A) ..O(1) [ ] 0.98 2.37 2.8704 111 |
3楼2010-09-06 14:39:44
phoeby_ice
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5楼2010-09-06 15:58:24
phoeby_ice
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6楼2010-09-06 16:05:03
10