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xiaowu787

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】RDF分析-lammps 已有12人参与

今天试着练习了compute rdf command
命令如下:
compute rdf all rdf 10
fix 5 all ave/time 10 1 10 c_rdf file rdf.out mode vector

用fix输出结果时似乎必须加上 mode vector才行,不然总报错。
可是计算结果出来了,不知道c_rdf[1] c_rdf[2] c_rdf[3]对应的是什么?总之感觉和文献上的对不上,请大家指点一下。
结果如下:
# Time-averaged data for fix 5
# TimeStep Number-of-rows
# Row c_rdf[1] c_rdf[2] c_rdf[3]
0 10
1 0.5 0 0
2 1.5 0.861377 2.73958
3 2.5 1.03893 11.7083
4 3.5 1.32539 33.9896
5 4.5 1.50393 75.6719
6 5.5 1.18676 124.74
7 6.5 1.83646 230.708
8 7.5 1.61828 354.969
9 8.5 1.44098 497.042
10 9.5 1.8949 730.359
10 10
1 0.5 0 0
2 1.5 0.864652 2.75
3 2.5 1.04496 11.7708
4 3.5 1.32942 34.1198
5 4.5 1.50469 75.8229
6 5.5 1.18524 124.828
7 6.5 1.84314 231.182
8 7.5 1.61224 354.979
9 8.5 1.44848 497.792
10 9.5 1.89866 731.573
20 10
1 0.5 0 0
2 1.5 0.871203 2.77083
3 2.5 1.04737 11.8125
4 3.5 1.33933 34.3281
5 4.5 1.5045 76.026
6 5.5 1.1729 124.521
7 6.5 1.84485 230.974
8 7.5 1.62316 355.609
9 8.5 1.4413 497.714
10 9.5 1.90031 731.698

也想做一个液态径向分布函数图


[ Last edited by xiaowu787 on 2010-8-28 at 21:11 ]
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刘雪鹏

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
i是中心原子,j是周围分布原子
8楼2014-09-23 15:38:01
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